人類、そして魔法少女たちに与えられた「銀河の後継者」という運命は、彼女らの小さな肩比べ、あまりにも大きく過酷であった。

#HALO×#マギレコ 舞台を21世紀の架空の都市から、26世紀の未来に移し、いろは達魔法少女もその時代の人々となっている。太陽系から宇宙各地に進出し植民地を築いていた人類は異星人の侵略によって絶滅の危機に瀕しており、人類を守るため、魔法少女は戦いに身を投じていく。