⑦ヒト生体タンパク質由来の抗菌ペプチド探索　第2章　抗菌ペプチド探索　２　apoE由来の抗菌ペプチドは、抗認知症効果もある？

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第２章　抗菌ペプチド探索　

２　apoE由来の抗菌ペプチドは、抗認知症効果もある？

a 30-mer peptide of apoprotein E 133–162 (LRVRLASHLRKLRKRLLRDADDLQKRLAVY)

apoE 1-299　https://www.rcsb.org/structure/1B68の中で
apoE133-162はオレンジ（162以降は途切れる）

　apoEは血中で脂質を運搬する「リポタンパク質」のひとつで、もともと、apoE 133-162部位は低密度リポ蛋白受容体（low-density lipoprotein receptor, LDLR）結合領域として知られていた。
　　https://www.pnas.org/doi/epdf/10.1073/pnas.83.8.2295

　われわれが、（おそらくはじめて）この、結合領域が、抗菌活性（ひいては抗腫瘍活性も）もつことを報告した。だが、生理的に、apoEが抗菌機能に貢献しているとはいえない、というのが我々の論文の面白いところであり弱点でもあった。
　Peptides　2000　Mar; 21(3): 327-330　
　　　A synthetic peptide of human apoprotein E with antibacterial activity
　In Vivo　2005 Jan-Feb;19(1):261-264
　　　Anti-tumor activity of an antibiotic peptide derived from apoprotein E

　２０年ぶりに、今回、論文検索すると、しらないうちにこのapoE 133–162 (LRVRLASHLRKLRKRLLRDADDLQKRLAVY)　に関して、以下のような知見が追加されてきたことがわかり、少し驚いた。

　この部位は、まずは、apoEの低密度リポ蛋白受容体との結合部位である。しかし、この領域は、ヘパリンと結合し、C1qと結合し、アミロイド蛋白と結合する。

　さらにはこの部位の前半由来ペプチドCOG1410：AS(Aib)LRKL(Aib)KRLL＝apoE 138-149
　（注）ここで、(Aib) は2-アミノイソ酪酸を示しています。この配列は、apoEのミメティックペプチドであり、apoEの特定の残基（138-149）を模倣し、2つのアミノ酸が変更されています。すなわち、われわれのapoE　peptide　(30mer)　での下記の太字部
　　apoE 133-162 (LRVRLASHLRKLRKRLLRDADDLQKRLAVY)

が、抗菌作用（両親媒性αherix構造により？）をしめし、脳挫傷時の脳神経保護作用（C1qと結合することにより？）を示し、アルツハイマー病でのアミロイド沈着抑制作用（アミロイド蛋白と結合することにより？）をしめした。

https://www.tandfonline.com/doi/full/10.2147/IDR.S403232

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38006963/

　ひとつ、追記すれば、現在アルツハイマー型認知症の治療薬には、エーザイ製薬の抗アミロイド蛋白質抗体（レカネマブ）に続いて、apoE抗体がアルツハイマー治療薬の候補のひとつになっているということだ。

　さらに、apoEに関して、最近では、認知症の早期診断　　例　https://www.sakurahp.or.jp/dock/apoe.html
で、その3つの主要なアイソフォーム：apoE2、apoE3、および apoE4を調べると、ε4を全く持たない遺伝子型に対して、 ε4を1つないし2つ持っている遺伝子型のアルツハイマ一病発症リスクは、右表の通り約3倍～12倍高くなると言われている。
■APOEε4によるアルツハイマー病発症への影響
遣伝子型 リスク(倍)
ε2/ε3 　　　　0.6
ε3/ε3　　　　 1.0
ε2/ε4､ε3/ε4 　3.2
ε4/ε4 　　　　11.6

この各々のアイソフォームをみると、
apoE2: 第112位のアルギニンがシステインに置換されています。
apoE3 (最も一般的な形態): 第112位にアルギニンがあり、第158位にシステインがあります。
apoE4: 第112位のアルギニンは変わらず、第158位のシステインがアルギニンに置換されています。

そして、われわれのapoE peptide　(30mer)
　　apoE 133-162 (LRVRLASHLRKLRKRLLRDADDLQKRLAVY)
は、ε4型（第158位のシステインがアルギニンに置換：太字）を採用しています。

　　　　　　　　＊

　つまり、
①COG1410(apoE138-149)で検討されていない、apoE peptide　(30mer)の後半部分 apoE 147-158
　　apoE 133-162 (LRVRLASHLRKLRKRLLRDADDLQKRLAVY) の太字部
②あるいは、apoE 133-162　全体

は両者とも、抗菌作用や、抗認知症効果を検討するに値すると思われます。

　　　　

①へのリンク：https://note.com/kojikoji3744/n/n73e095a67c68

次⑧ヘのリンク：⑧ヒト生体タンパク質由来の抗菌ペプチド探索　第2章　抗菌ペプチド探索　３　新規のタンパク質由来抗菌ペプチド候補｜kojikoji (note.com)

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