シーケンスプライマーの作成

【使うアプリ・ブラウザ】
・SGN
・Bioedit
・Snap gene viewer
・Primer 3 tPlus
・ThermoFisher社ツール（2次構造の確認）

【手順】
・SGN開く→ToolのBLAST
・(Categories) Popular Datasets ,(Database) Tomato genome chromosomes SL2.50 or 3.0
・対象の遺伝子の情報を論文などから検索
　→マーカー情報あればプライマーのFとRのe-遺伝子配列コピーし、BLASTで検索（出てこなければAdvanced optionのe-valueを１にする）
・遺伝子の染色体上の場所（数字）をコピー
・SGNのToolのJBBrowser開く
　→左上のGenomeからSL2.50or3.0に変更
・コピーした数字を貼り付けGoをクリック
・欲しい長さの配列まで虫眼鏡のマイナスで縮小する
・Reference sequenceのプルダウンからSave track Data (visible region)でSaveして開く（Snap gene Viewerで開かれる）
・全配列をコピー
・Plimer 3 Plusに貼り付けして、General SettingからProduct rangeを設定し、Pick Primerをクリック
・プライマーが出てくるのでコピーし、Snap Gene Viewerで検索
　→プライマー（P）タブからプライマーを追加する（FとR）
・ThermoFisher社ツールでDimerがないか確認
・BLASTで特異性を確認（ゲノムの中で特異的な配列かを検索する）
・発注する