記事一覧
一般化ランジュバン方程式を用いた局所拡散係数の導出
本記事では，一般化ランジュバン方程式を出発点にすることにより，局所拡散係数が
$$
\begin{align*}
D(z)&=\lim_{s\rightarrow 0}\frac{-\tilde{C}_{v}(s;z)\langle z^2\rangle\langle\dot{z}^2\rangle}{\tilde{C}_{v}(s;z)\left[s\langle z^2\rangle+\la
Infrequent Metadynamics
本記事ではMetadynamicsを用いて効率的に状態間の（平均）遷移時間を予測する目的で提案されたInfrequent Metadynamicsについて解説します。
"Infrequent"の言葉の通り，Infrequent Metadynamicsは技術的にはバイアスポテンシャルの更新を単にInfrequentにした手法ですが，"Infrequent"であることが本質的に重要な役割を果たします
Google Geminiにfitbit payがPASMOに対応しているか聞いたところ、なんと対応していると回答。。。参考サイトにはSuicaしか書いてないとツッコむと、その情報元が間違っていると自信満々。。。大丈夫かいな。。。
τ‑Random Acceleration Molecular Dynamics Simulations
本記事では，参考文献1で提案されたτ‑Random Acceleration Molecular Dynamics（以下，τ-RAMD）について解説します。参考文献1は（少なくても2024/06/20時点において）オープンアクセスのため，無料で内容を閲覧することができます。
背景低分子創薬では標的タンパクに特異的に強く結合する化合物を設計することが必須条件ですが，効能や安全性の観点から「強く結合
AviotのTE-ZX1を買ってみた話
最近，普段使いしている完全ワイヤレスイヤホン（ZE3000：プライベート用，EAH-AZ60：仕事用）では物足りなくなり，それらよりも高級な完全ワイヤレスイヤホンの購入を検討していました。
最終的にAviotのTE-ZX1を購入しましたので，それまでの経緯や今まで使用してきたZE3000，EAH-AZ60との比較を紹介したいと思います。
端的な結論としては，良い買い物であった，です。
イヤホンレ
Metadynamicsの境界補正について
本記事では参考文献１で提案された，Metadynamicsの境界補正方法（McGovern−de Pablo boundary conditions）について解説します。
Metadynamics自体について知りたい方は，以下の記事のAppendix Aを併せてご参照ください。
問題設定系の配置に関する自由度をベクトル$${\mathbf{q}=\begin{bmatrix}q_1&q_2&\d
【書評】Statistical Mechanics: Theory and Molecular Simulation
Statistical Mechanics: Theory and Molecular SimulationはMark E Tuckermanによって著された分子シミュレーションに関連した熱・統計物理学，及び量子力学の参考書（以下，タッカーマン統計力学）になります。
現時点では（恐らく）和訳がないこともあり，日本での知名度はあまりないような気がしますが，被引用数が約1,600を超えていることを考