解説した論文リスト(適宜アップデートされています)

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解説論文30
論文名:Epigenetic inheritance of diet-induced and sperm-borne mitochondrial RNAs
掲載された雑誌:Nature
掲載された論文に関する情報:2024, Volune 630, p720–727
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1038/s41586-024-07472-3

解説論文29
論文名:Interaction with a phage gene underlie costs of a β-lactamase
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2024, Volume 15 Issue 2
掲載された論文のDOI:https://doi.org/10.1128/mbio.02776-23

解説論文28(解説ならず…)
論文名:Temporal dynamics of the multi-omic response to endurance exercise training
掲載された雑誌:Nature
掲載された論文に関する情報:2024, Volume 629, pages174–183
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1038/s41586-023-06877-w

解説論文27
論文名:Infant microbes and metabolites point to childhood neurodevelopmental disorders
掲載された雑誌:Cell
掲載された論文に関する情報:2024, Volume 187, Issue 8, 1853-1873.e15
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1016/j.cell.2024.02.035

解説論文26
論文名:Autoreactive T cells target peripheral nerves in Guillain–Barré syndrome
掲載された雑誌:Nature
掲載された論文に関する情報:2024 volume 626, pp160–168
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1038/s41586-023-06916-6

解説論文25
論文名:A synthetic differentiation circuit in Escherichia coli for suppressing mutant takeover
掲載された雑誌:Cell
掲載された論文に関する情報:2024 Volume 187, Issue 4, pp 931-944.e12
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1016/j.cell.2024.01.024

解説論文24
論文名:Precision microbial intervention improves social behavior but not autism severity: A pilot double-blind randomized placebo-controlled trial
掲載された雑誌:Cell Host & Microbe
掲載された論文に関する情報:2024 Volume 32, Issue 1, pp 106-116.e6
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1016/j.chom.2023.11.021

解説論文23
論文名:Bispecific dendritic-T cell engager potentiates anti-tumor immunity
掲載された雑誌:Cell
掲載された論文に関する情報:2024 Volume 187, ISSUE 2, P375-389.e18,
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1016/j.cell.2023.12.011

解説論文22
論文名:Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice
掲載された雑誌:Cell Host & Microbe
掲載された論文に関する情報:2023 Volume 31, ISSUE 12, P1974-1988.e4
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1016/j.chom.2023.11.004

解説論文21
論文名:Comparison of Helicobacter pylori positive and negative gastric cancer via multi-omics analysis
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2023 Volume 14 Issue 6
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/mbio.01531-23

解説論文20
論文名:An early-life microbiota metabolite protects against obesity by regulating intestinal lipid metabolism
掲載された雑誌:Cell Host & Microbe
掲載された論文に関する情報:2023, Volume 31, ISSUE 10, P1604-1619.e10,
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1016/j.chom.2023.09.002

解説論文19
論文名:Bacteriophage infection and killing of intracellular Mycobacterium abscessus
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2023, Ahead of Print
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/mbio.02924-23

解説論文18
論文名:Vertical and horizontal gene transfer tradeoffs direct plasmid fitness
掲載された雑誌:Molecular Systems Biology
掲載された論文に関する情報:2023, 19:e11300
掲載された論文のDOI:doi.org/10.15252/msb.202211300

解説論文17
論文名:Genome-wide screens reveal shared and strain-specific genes that facilitate enteric colonization by Klebsiella pneumoniae
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2023, Ahead of Print
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/mbio.02128-23

解説論文16(強制終了されました。すいません)
論文名:Gene recoding by synonymous mutations creates promiscuous intragenic transcription initiation in mycobacteria
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2023, Vol. 14, No. 5
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/mbio.00841-23

解説論文15
論文名:Euo is a developmental regulator that represses late genes and activates midcycle genes in Chlamydia trachomatis
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2023, Vol. 14, No. 5
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/mbio.00465-23

解説論文14
論文名:The gut microbiota contributes to the pathogenesis of anorexia nervosa in humans and mice
掲載された雑誌:Nature Microbiology
掲載された論文に関する情報:2023, volume 8, pages 787–802
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1038/s41564-023-01355-5

解説論文13
論文名:Dissemination of IncI plasmid encoding bla CTX-M-1 is not hampered by its fitness cost in the pig’s gut
掲載された雑誌:Antimicrobial Agents and Chemotherapy
掲載された論文に関する情報:2023, Vol. 67, No. 10 
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/aac.00111-23

解説論文12
論文名:Multivalent human antibody-centyrin fusion protein to prevent and treat Staphylococcus aureus infections
掲載された雑誌:Cell host &Microbe
掲載された論文に関する情報:2023, Vol. 31, ISSUE 5, P751-765.E11 
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1016/j.chom.2023.04.004

解説論文11
論文名:Systematic mapping of chemoreceptor specificities for Pseudomonas aeruginosa
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2023, Vol. XXX, No. X
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/mbio.02099-23

解説論文10
論文名:CsbD, a Novel Group B Streptococcal Stress Response Factor That Contributes to Bacterial Resistance against Environmental Bile Salts
掲載された雑誌:Journal of Bacteriology
掲載された論文に関する情報:2023, Vol. 205, No. 6
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/jb.00448-22

解説論文9
論文名:Hyperphosphorylation of the Group A Streptococcal Control of Virulence Regulator Increases Promoter Occupancy Specifically at Virulence Factor-Encoding Genes
掲載された雑誌:Journal of Bacteriology
掲載された論文に関する情報:2023, Vol. 205, No. 6
掲載された論文のDOI:https://doi.org/10.1128/jb.00118-23

解説論文8
論文名:Rapid and strain-specific resistance evolution of Staphylococcus aureus against inhibitory molecules secreted by Pseudomonas aeruginosa
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2023, Vol. X, No. X
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/mbio.03153-22

解説論文7
論文名:Off-Target Integron Activity Leads to Rapid Plasmid Compensatory Evolution in Response to Antibiotic Selection Pressure
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2023, Vol. 14, No. 2
掲載された論文のDOI:https://journals.asm.org/doi/10.1128/mbio.02537-22

解説論文6
論文名:Mapping temperature-sensitive mutations at a genome scale to engineer growth switches in Escherichia coli
掲載された雑誌:Molecular Systems Biology
掲載された論文に関する情報:2023, e11596
掲載された論文のDOI:doi.org/10.15252/msb.202311596

解説論文5
論文名:CRISPR Screens Identify Toxoplasma Genes That Determine Parasite Fitness in Interferon Gamma-Stimulated Human Cells
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2023 Volume 14 Issue 2
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/mbio.00060-23

解説論文4
論文名:Cryo-EM Structures of the Klebsiella pneumoniae AcrB Multidrug Efflux Pump
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2023 Volume 14 Issue 3
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/mbio.00659-23

解説論文3
論文名:Engineered Superinfective Pf Phage Prevents Dissemination of Pseudomonas aeruginosa in a Mouse Burn Model
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2023 Volume 14 Issue 3
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/mbio.00472-23

解説論文2
論文名:Insertion Sequences Determine Plasmid Adaptation to New Bacterial Hosts
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2023 Volume 14 Issue 3 e01983-21
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/mbio.03158-22

解説論文1
論文名:Toxin Induction or Inhibition of Transcription or Translation Posttreatment Increases Persistence to Fluoroquinolones
掲載された雑誌:mBio
掲載された論文に関する情報:2021 Volume 12 Issue 4 e01983-21
掲載された論文のDOI:doi.org/10.1128/mBio.01983-21


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Nature解説50
Volume 632 Number 8023
集団遺伝学:新石器時代の農耕民の6世代にわたるペストへの反復感染
遺伝学:世界的に多様なヒトコホートにおける遺伝子発現の多様性の要因

Nature解説49
Volume 631 Number 8022
進化遺伝学:ウマを用いた移動の普及はユーラシアで紀元前2200年頃に始まった
微生物学:細菌はユビキチン様タンパク質を結合させてファージの組み立てを妨げる
微生物学:細菌の抗ウイルス防御における真核生物様のユビキチン化システム

Nature解説48
Volume 631 Number 8021
ゲノミクス:98万3578人におけるタンパク質コード領域の多様性についての詳細なカタログ
植物科学:効率的な植物ゲノム改変のための、トランスポザーゼに補助される標的部位への組込み

Nature解説47
Volume 631 Number 8020
微生物遺伝学:肺炎球菌の地理的移動と適応度の動態

Nature解説46
Volume 631 Number 8019
構造生物学:プライムエディターによるpegRNA依存性逆転写の構造基盤
発生生物学:ヒト生殖細胞系列におけるエピジェネティックな再プログラム化のin vitro再構築
進化学:古代のマラリア原虫ゲノムから明らかになったヒトマラリアの歴史

Nature解説45
Volume 630 Number 8018
微生物学:細菌のDdmDE防御系によるプラスミドの標的化と破壊
ゲノミクス:マルチスケールのトポロジーによって細胞以下レベルの空間トランスクリプトミクスで細胞を分類する

Nature解説44
Volume 630 Number 8017
代謝:食餌が誘発する精子由来ミトコンドリアRNAのエピジェネティック遺伝

Nature解説43
Volume 630 Number 8016
計算生物学:生体分子間相互作用のAlphaFold3による正確な構造予測
ゲノミクス:類人猿の性染色体の完全塩基配列と比較解析
微生物学:腸マイクロバイオームを温存するグラム陰性細菌選択的な抗生物質

Nature解説42
Volume 630 Number 8015
社会科学:企業は消費者の反発にもかかわらずオンラインの誤情報に意図せず資金を提供している
社会科学:1月6日事件後のプラットフォーム排除により、ツイッター上での誤情報の到達範囲は縮小した
健康科学:リアルワールドデータからのデジタル病理学のための全スライド基盤モデル

Nature解説41
Volume 626 Number 8014
生化学:ヒトのチロシンキノームに固有の基質特異性
進化学:子の世話を促す新たな副腎細胞タイプの進化

Nature解説40
Volume 626 Number 8013
健康科学:全球規模の変化を駆動する要因と感染症のリスクに関するメタ解析
免疫学:門脈近傍のマクロファージが共生微生物による肝臓炎症を防ぐ

Nature解説39
Volume 626 Number 8012
微生物学:父系マイクロバイオームの乱れは仔の適応度に影響を与える
がん:3Dゲノムマッピングで明らかになったヒト膵臓前がん状態の多病巣性

Nature解説38
Volume 626 Number 8011
古遺伝学:大規模な家系図のネットワークから明らかになった、アバール人コミュニティーの社会的慣行
遺伝学:単一細胞解析によって明らかになった状況依存的な細胞レベルのmtDNAの選択
腫瘍生物学:ex vivoミニ結腸での大腸がん発生の時空間的解明

Nature解説37
Volume 626 Number 8010
進化遺伝学:ヒトの完全なセントロメアの多様性と進化
細胞生物学:加齢するヒト骨格筋の多モード細胞アトラス
分子生物学:持久力運動トレーニングへのマルチオミクス応答の経時的動態

Nature解説36
Volume 626 Number 8009
テクトニクス:マグマ貫入によって明らかになった大洋中央海嶺の逆断層運動
医学研究:ネクロトーシス阻害は重症インフルエンザの肺損傷を防ぐ

Nature解説35
Volume 626 Number 8008
神経免疫学:静脈叢に関連するリンパ系ハブが髄膜の体液性免疫を支える
生物工学:内在性の低分子RNA結合タンパク質を使ってプライム編集を改善する

Nature解説34
Volume 626 Number 8007
医学研究:大腸がんニッチで優勢なFusobacterium nucleatumの独特なクレード

Nature解説33
Volume 626 Number 8005
考古学:人類は140万年前に東方からヨーロッパへと分散した
がんゲノミクス:治療中の小細胞肺がんの進化の軌跡

Nature解説32
Volume 626 Number 8006
遺伝学:循環血中代謝バイオマーカーのゲノム規模特性解析
遺伝学:RNAを介する片親起源効果の根底にある利己的な対立

Nature解説31
Volume 626 Number 8004
がんゲノミクス:肺腺がんでの上皮細胞の状態と可塑性のアトラス
グローバルヘルス:ラストマイル配送はシエラレオネにおけるワクチン接種を増加させる

Nature解説30
Volume 626 Number 8003
ゲノミクス:All of Us研究プログラムのゲノムデータ
神経科学:空間トランスクリプトミクスにより明らかになった長期記憶におけるニューロン–アストロサイト間の相乗効果
免疫学:免疫細胞の相互作用をin vivoで普遍的に記録する
エピジェネティクス:ヒットエンドラン型のエピゲノム編集によるin vivoでの持続的で効率の良い遺伝子サイレンシング

Nature解説29
Volume 626 Number 8002
動物行動学:ヒゲクジラ類の発音の根底にある進化的新規性
進化遺伝学:ブラジルのコロンブス以前の時代のゲノムからトレポネーマ症の歴史を見直す

Nature解説28
Volume 626 Number 8001
進化学:ヒトと類人猿の尾の喪失という進化の遺伝的基盤について
おまけ
発生生物学:マウスの原腸胚から出生までの出生前発生についての単一細胞タイムラプス
分子生物学:自律性トランスポゾンは体細胞での抑制が確実に起こるように自身の塩基配列を調整する

Nature解説27
Volume 626 Number 8000
分子生物学:翻訳は機能しない転写複合体を選択的に破壊する

Nature解説26
Volume 626 Number 7999
システム生物学:転写–複製相互作用によって明らかになった細菌のゲノム調節
免疫療法:T細胞に自然に生じる変異が改変T細胞による治療を増強する

Nature解説25
Volume 626 Number 7998
微生物学:未培養タクソンの未知遺伝子の機能的および進化的な重要性

Nature解説24
Volume 626 Number 7997
神経科学:痛がる他者への援助行動の皮質による調節

Nature解説23
Volume 626 Number 7997
神経科学:痛がる他者への援助行動の皮質による調節

Nature解説22
Volume 625 Number 7995
微生物学:リポ多糖輸送体を標的とする新規抗生物質クラス
微生物学:膜間輸送体内でリポ多糖を捕捉する新たな抗生物質

Nature解説21
Volume 625 Number 7993
微生物学:栄養不良児のためのマイクロバイオーム指向性食品に含まれる生物活性グリカン

Nature解説20
Volume 624 Number 7992
免疫学:糖尿病では肺の樹状細胞代謝がウイルス感染感受性の基礎となる

Nature解説19(実は解説できていませんけれどしょうがないです)
Volume 624 Number 7991
神経科学:マウス全脳の細胞タイプの高分解能トランスクリプトーム空間アトラス
神経科学:成体マウス脳の分子的細胞構築
神経科学:マウス全脳の分子的に定義され空間的に分解された細胞アトラス
神経科学:ニューロンのエピゲノミクスと長距離投射の全脳規模の対応
神経科学:成体マウス脳の単一細胞DNAメチロームと3Dマルチオミクスアトラス
神経科学:成体マウス脳のクロマチン接近可能性の単一細胞解析
神経科学:哺乳類新皮質の遺伝子調節プログラムの保存と分岐
神経科学:マウスの脳規模での脊髄投射ニューロンのトランスクリプトームによる分類法
神経科学:脊椎動物の網膜におけるニューロンのクラスとタイプの進化

Nature解説18
Volume 624 Number 7990
微生物学:緑膿菌でのポリン非依存的な蓄積は抗生物質の発見を可能にする

Nature解説17
Volume 623 Number 7989
がん:トランスバクセン酸はCD8+ T細胞と抗腫瘍免疫を再プログラム化する

Nature解説16
Volume 623 Number 7988
遺伝学:単一細胞分解能での胚規模の逆遺伝学
がん治療:ペプチドを中心としたCARによる細胞内がんタンパク質の標的化


Nature解説15
Volume 623 Number 7987
微生物学:バクテリオファージはRNAを基盤とする抗CRISPRを用いてCRISPR–Cas免疫を抑制する
免疫学:潜伏性ヒトヘルペスウイルス6はCAR T細胞中で再活性化される

Nature解説14
Volume 623 Number 7986
がんゲノミクス:11種類の腫瘍で見られた、がん推移の際のエピジェネティック調節

Nature解説13
Volume 623 Number 7985
保全:中国の在来野生生物の違法な捕獲に関する評価

Nature解説12
Volume 622 Number 7984
ゲノミクス:メキシコシティーの成人14万人に対する遺伝子型決定、塩基配列解読および解析

Nature解説11
Volume 622 Number 7983
古生物学:比類なく保存された消化管内容物から明らかになった三葉虫の古生理学

Nature解説10
Volume 622 Number 7982
臓器移植:異種移植用のヒト化ブタドナーの設計と検証

Nature解説9
Volume 622 Number 7981
健康科学:網膜画像から疾患を検出するための一般化可能な基礎モデル

Nature解説8
Volume 621 Number 7980
がん免疫療法:好中球上のCD300ldが腫瘍による免疫抑制に必要である

Nature解説7
Volume 620 Number 7979
健康科学:低・中所得国における幼児期の直線的な成長遅滞」、「健康科学:低・中所得国における小児の消耗症と同時に起こる発育阻害」、「健康科学:低資源環境での小児の成長遅滞の原因と結果

Nature解説6
Volume 620 Number 7978
ゲノミクス:ヒトY染色体の完全塩基配列

Nature解説5
Volume 620 Number 7977
細胞生物学:ハダカデバネズミのHas2によるヒアルロン酸の増加はマウスの健康寿命を改善する

Nature解説4
Volume 620 Number 7976
計算生物学:タンパク質の構造と機能のRFdiffusionによるde novo設計

Nature解説3
Volume 620 Number 7975
免疫学:乳酸は樹状細胞においてHIF-1αを安定化することで中枢神経系自己免疫を抑制する

Nature解説2
Volume 620 Number 7974
感覚生物学:ハエに磁気感覚は本当にあるのか

Nature解説1
Volume 620 Number 7973
がん:治療によって誘導されるAPOBEC3Aは持続生残がん細胞の進化を促す


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