RapidCopy(AppStore版)とRapidCopyProの違いはなんですか？

コピー動作のバッチ機能の有無やコマンドラインからの起動サポート、

ODAオプション(有料)への対応などに違いがあります。

コピーの速度や動作の安定性などの基本的な機能については差はありません。
大量のSSDやHDDを順番にコピーするような用途の場合はRapidCopyProが有効ですが、
一般的な２、３台程度までのファイルコピー用途であればRapidCopyProは不要です。

詳細は以下のリンクを参照してください。
https://rapidcopy.jp/rapidcopy-pro