Evaluating the utility of a high throughput thiol-containing fluorescent probe to screen for reactivity: A case study with the Tox21 library
Tox21プログラムにおける生物活性のハイスループットスクリーニング（HTS）アッセイは、様々な生物学的標的や経路を評価することを目的としているが、これらのデータの解釈における大きな障壁は、非特異的反応性化学物質を特定することを目的としたハイスループットスクリーニング（HTS）アッセイがないことである。これは、特定のアッセイで試験する化学物質の優先順位付け、反応性に基づくプロミスキャスな化学物質の特定、さらに皮膚感作のように、必ずしも受容体を介した作用ではなく、非特異的なメカニズムで作用する危険性を扱う上で重要な点である。ここでは、チオール反応性化合物の同定を可能にする蛍光ベースのHTSアッセイを用いて、Tox21 10K化学ライブラリの7,872種類の化学物質をスクリーニングしました。親電子性情報をコード化した構造アラートを用いて、活性のある化学物質をプロファイリング結果と比較した。化学指紋に基づくランダムフォレスト分類モデルを開発し、アッセイ結果を予測し、10倍の層別クロスバリデーション（CV）により評価した。検証セットの平均CVバランス精度は0.648であった。開発したモデルは、化学構造上の特徴のみに基づいて、未検査の化学物質の潜在的な親電子反応性をスクリーニングするためのツールとして有望である。