Droplet-based single-cell joint profiling of histone modifications and transcriptomes

Droplet-based single-cell joint profiling of histone modifications and transcriptomes - Nature Structural & Molecular Biology

1. 本研究の学術的背景，研究課題の核心をなす学術的「問い」は？
- Paired-Tagと呼ばれる組み合わせ索引ベースの方法を利用することで、ヒストン変更と遺伝子発現を同時に単一細胞分解能でマッピングする方法が以前に報告された。しかし、Paired-Tagの手順が煩雑であるため、研究者による普及が遅れている。本研究の学術的背景や核心となる問いは、Paired-Tagの手順を改良し、同じ目的をより操作しやすくする手法の開発にある。

2. 本研究の目的及び学術的独自性と創造性は？
- 本研究の目的は、Paired-Tagの手順を改良することで、より迅速かつ利便性の高い方法を提供することである。Paired-Tagの手順を改良することで、この技術を研究者がより一般的に利用できるようになる。本研究の独自性と創造性は、ドロップレットベースのPaired-Tagプロトコルの開発にある。本手法は迅速であり、組織における各細胞タイプにおいて、_cis_制御要素の候補を識別し、それらのダイナミックな染色体状態を目標遺伝子発現に関連付けることに優れた性能を発揮する。

3. 本研究の着想に至った経緯や，関連する国内外の研究動向と本研究の位置づけは？
- Paired-Tagの手順を改善することで、より操作しやすくする方法を提供するために、ドロップレットベースのPaired-Tagプロトコルの開発が行われている。Paired-Tagは、従来の技術に比べて、染色体のダイナミックな状態と遺伝子発現を同時に識別できるようになることで、広く注目されている。

4. 本研究で何をどのように，どこまで明らかにした？
- 本研究では、ドロップレットベースのPaired-Tagプロトコルを用いて、哺乳動物細胞株や原発性脳組織を対象に実験を行い、_cis_制御因子の候補を識別し、それらのダイナミックな染色体状態を目標遺伝子発現に関連づけることができた。

5. 本研究の有効性はどのように検証した？
- 本研究の有効性は、ドロップレットベースのPaired-Tagプロトコルを使用して、哺乳動物細胞株や原発性脳組織において、_cis_制御因子の候補を識別し、それらのダイナミックな染色体状態を目標遺伝子発現に関連付けることで明らかになった。これにより、Paired-Tagの手順を改良することで、この技術をより効率的に実施できることが示された。