NanoViromics: long-read sequencing of dsRNA for plant virus and viroid rapid detection
1. 本研究の学術的な背景と研究が解決する問題は何ですか？
==> 感染症の拡大を抑制するため、また、認定されたクリーンプラント資材を提供するために、ウイルス病原体を検出する必要があります。これに対し、本研究では、簡便で信頼性が高く、安価な診断ツールが必要であるという問題を解決するため、Grapevinesにおいて、dsRNAベースのナノポアシーケンシングプロトコルを開発しました。
2. 本研究の目的及び学術的独自性と創造性は何ですか？
==> 本研究の目的は、dsRNAベースのナノポアシーケンシングプロトコルを、他のシーケンシング技術に比べてより信頼性が高く安価で簡便に使用できることを示すことでした。また、本研究により、グレープワインにおける複数のウイルス感染症を一貫して検出できることが明らかになりました。
3. 研究の着想を得た経緯や、関連する国内外の研究動向とは何ですか？
==> 過去の研究により、ナノポアシーケンシングプロトコルが、他のシーケンシング技術よりも信頼性が高く、安価であることが示されています。
4. 本研究で何をどのように、どこまで明らかにした？
==> Grapevinesにおいて、dsRNAベースのナノポアシーケンシングプロトコルを使用して、ウイルスおよびビロイドを検出する手法の開発および検証を行いました。実験の結果、本手法の方が、ウイルスの検出において、他のシーケンシング技術よりも信頼性が高いことが明らかになりました。また、二つの分類ワークフローにも着目し、それらのメリット・デメリットを評価しました。
5. 本研究の有効性はどのように検証した？
==> 本研究では、dsRNAベースのナノポアシーケンシングプロトコルを使用して、Grapevines中で複数のウイルス感染を一貫して検出できることを実験で示しました。