FASTAファイルを2行単位にするスクリプト
塩基配列中に改行が入ったFASTAファイルを2行単位のFASTAファイルに変換するシェルスクリプトです。Linux環境で動きます。
アセンブルしたデータやオンラインデータベースからダウンロードしたFASTAファイルは、配列中に改行が入っていることがしばしばです。
解析ソフトに投入するときはそんなに困らないのですが、目的の配列をgrepで抽出しようとするときに配列行が何行あるかわからず悩みまくった経験があるので、2行単位のスタイルに直して使っています。
2行単位であれば
