MACでpipを使ってpygmtをインストール
自分用メモ:condaを使わずにpipでpygmtをインストールする方法
homebrewでGMTをインストール(https://docs.generic-mapping-tools.org/latest/install.html)
python -m pip install pygmt(https://www.pygmt.org/dev/install.html)
これで、jupyter上でpygmtが動く。
pipだとエラーが出るという記述もあるが、自分の場合は特にエラーがなく動いた。
GMTをサイトから自分でインストールした場合はエラーが出たので、homebrewでインストールし直すのが良さそう。