STARをインストールする

STARは RNA-Seq をマッピングするツール。まずは、これを使ってデータを処理してみます。
ということで、STARをインストールします。

expressionフォルダの中にToolsディレクトリを作ってその中にSTARをダウンロードします。

現在のディレクトリの状況

STARの公式サイトを見ると、2.7.4aが最新でした。

コマンド　wget https://github.com/alexdobin/STAR/archive/2.7.4a.tar.gz

コマンド　tar -xzf 2.7.4a.tar.gz

マニュアルを見ると
https://github.com/alexdobin/STAR/blob/master/doc/STARmanual.pdf

Ubuntuの場合は、

コマンド　sudo apt-get update

コマンド　sudo apt-get install make

インストールができたかどうか確認のために

コマンド　STAR-2.7.4a/bin/Linux_x84_64_static/STAR --version

インストールしたバージョンが表示されればOK

いよいよ、STARでマッピングしてみます！