SRAToolkitのインストール

下記のサイトを参考にインストールします。
Installing SRA Toolkit
https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/02.-Installing-SRA-Toolkit

ubuntuの場合は、
https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/02.-Installing-SRA-Toolkit#1-fetch-the-tar-file-from-the-canonical-location-at-ncbi
まずは、ダウンロード

wget --output-document sratoolkit.tar.gz http://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz

ダウンロードした場所もしくは、別の場所で解凍します。

sudo tar -zxvf sratoolkit.tar.gz

解凍されたら確認します。このファイルの場合は、
sratoolkit.2.10.9-ubuntu64　ディレクトリがありました。
このディレクトリの中にあるbinディレクトリにパスを通します。

export PATH=$PATH:$PWD/sratoolkit.2.10.9-ubuntu64/bin

下記のコマンドでパスの確認

which fastq-dump

home直下にtoolsを作成し、解凍したので下記のように表示されました。

/home/tools/sratoolkit.2.10.9-ubuntu64/bin/fastq-dump

これでSRAToolkitのインストールは終了。