Biocondaのインストール

コマンド　conda activate

condaの環境に入ります。
(base) asuzuki@DESKTOP-CFEKD3K:~$ conda activate

Biocondaを使うために必要なBiocondaチャネルとbiocondaが依存する他のチャネルを追加します。

初めに現在のチャンネルを確認するといいと思います。

コマンド　conda config --get channels

今回の場合は　defaults はすでに存在していました。

コマンド
conda config --add channels defaults
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels conda-forge

優先順位が正しく設定されるように、この順序で追加することが重要です。（conda-forgeを最高の優先順位にすること）

…とBiocondaの公式サイトに書いてあります。

Bioconda
bioconda.github.io/user/install.html
User Docs
      |__    Getting Started
　　　|__　２．Set up Channels
を参考にしてください。

ちなみに外のサイトを見てチャネル追加をしたので
順位を入れ替えなければなりません。
もし間違えてしまったら、こちらのconda公式サイトを参考に

conda
    |__    User guide
          |__    Task
               |__    Managing channels        
https://conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/tasks/manage-channels.html

conda-forge   defaults  conda-forge の順になってしまっているので
defaultsを最低順位にするために append コマンドを使用します。

コマンド　conda config --append channels defaults

すでに追加されている場合は優先順位を変えてくれます。

次は、conda-forgeを最優先にするためにprependコマンドを使用します。

コマンド　conda config --prepend channels conda-forge

これで確認します。

コマンド　conda config --get channels

--add channels 'defaults' # lowest priority
--add channels 'r'
--add channels 'bioconda'
--add channels 'conda-forge' # highest priority
これでBiocondaのインストールはOKです。

公式サイト
BIOCONDA
https://bioconda.github.io/index.html
CONDA
https://docs.conda.io/en/latest/#