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Biocondaのツールのインストール

「次世代シークエンサー DRY解析教本(秀潤社)」で勉強しています。
このあと実践するために、本の中で使用するBiocondaのツールをインストールします。

1.SRA Toolkit(SRA Tools)
2.Trim galore!
3.kallisto


1.SRA Toolkit(SRA Tools)

このツールに入っているfasterq-dimpでSRA形式のファイルからFASTQ形式の配列データを取得します。

コマンド conda install -c bioconda sra-tools

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2.Trim galore!

コマンド conda install -c bioconda trim-galore

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3.kallisto

コマンド conda install -c bioconda kallisto

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これで準備は完了です。

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