税理士の渋谷です。
紙で保存していた場合には、青色申告の取り消し事由になるとはっきり記載されています。
が、実務上、例えばちょっとしたミスがあって即アウトで取り消されるかというとその可能性は低いのではないかと思います(たぶん)。
以下、一問一答問66より。
後段に記載されている通り、指針に従って判断するとのことで、指針には以下のように書かれています。
取り消される可能性ももちろんあり得えますが、「改善可能性」と書かれていますので、要件を満たそうと努力していたがミスしてしまった、という風な事業者にまで即取り消しということはないと思われます。