脚注 doubutukopipe uxiki
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注釈
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^ 左上から順に、1段目：ヒトデの一種（棘皮動物門星形動物亜門ヒトデ綱）、クダカイメン Aplysina fistularis（海綿動物門）、セイヨウダンゴイカ Sepiola atlantica（軟体動物門頭足綱）、
2段目：ミズクラゲ Aurelia aurita（刺胞動物門鉢虫綱）、ガの一種 Hypercompe scribonia（節足動物門六脚亜門昆虫綱）、ゴカイの一種 Nereis succinea（環形動物門多毛綱）、
3段目：ヒレジャコ Tridacna squamosa（軟体動物門二枚貝綱）、シベリアトラ（脊索動物門脊椎動物亜門哺乳綱）、ホヤの一種Polycarpa aurata（脊索動物門尾索動物亜門ホヤ綱）、
4段目：クマムシの一種（緩歩動物門異クマムシ綱）、淡水産コケムシの一種（外肛動物門掩喉綱）、ウツボの一種 Enchelycore anatina（脊索動物門脊椎動物亜門条鰭綱）、
5段目：カニの一種 Liocarcinus vernalis（節足動物門甲殻亜門軟甲綱）、鉤頭動物の一種 Corynosoma wegeneri（輪形動物門古鉤頭虫綱）、アオカケス（脊索動物門脊椎動物亜門鳥綱）、
6段目：ハエトリグモの一種（節足動物門鋏角亜門蛛形綱）、ヒラムシの一種プセウドセロス・ディミディアートゥス Pseudoceros dimidiatus（扁形動物門渦虫綱）、ホウキムシ類のアクチノトロカ幼生（箒虫動物門）^ a b ただし、真核生物の2019年最新の分類であるAdl et al. (2019)では採用されていない。
^ 明治以前の日本では、中国本草学の影響により生物各群を草・虫・魚・獣などと並列的に扱うことが一般的であり、生物を動物と植物に大別することは西欧の学問の流入以降に普及した考えである[2]。
^ 原生動物は進化的に異なる雑多な生物をまとめたグループ（多系統群）であり、ミニステリアなどの一部の生物を除き後生動物とは系統的に遠縁である。
^ 藤田 (2010) では、分子系統解析によればこれらの動物門は最古の化石より10億年以上遡ると推測されている[127]とあるが、これは正しくない。
^ ガッコウチュウと呼ばれることもあるが[142]、顎口虫は線形動物の寄生虫 Gnathostoma にも用いられる[143]。
^ a b 刺胞動物と有櫛動物は外見が類似しているので腔腸動物門としてまとめられていたが、有櫛動物は刺胞がなく、上皮細胞が多繊毛性であり、決定性卵割であるといった刺胞動物との決定的違いがあり、しかも分子系統解析により腔腸動物が単系統とならないことがわかったので両者は別の門として分けられている[144]
^ かつて扁形動物門に分類されていた珍渦虫と無腸動物を新たな門として立てたもの[145]。その系統的位置に関しては、左右相称動物の最も初期に分岐したとする説[146][147] と後口動物の一員であるとする説[148][149] がある。
^ a b c 脊椎動物・頭索動物・尾索動物の3門を亜門とし、まとめて脊索動物門とすることも多い。詳しくは#脊索動物を参照
^ a b 直泳動物門と二胚動物門はかつて中生動物門とされており[151]、原生動物から後生動物に進化する過程であると過去には見られていたが、2010年現在では寄生生活により退化した後生動物（螺旋動物）であると見られている[152]
^ 鉤頭動物 Acanthocephala は輪形動物に内包され、狭義の輪形動物は側系統となる。狭義の輪形動物および鉤頭動物を門として残し、広義の輪形動物を共皮類 Syndermata とすることもある[153]。
^ 星口動物・ユムシ動物・有鬚動物は過去には門として立てられていた事もあるが、2018年現在は環形動物門の一部とみなされている[154]。
^ ギリベ (2016) における系統仮説では有輪動物の系統位置が不明であり前口動物内に曖昧さをもって置かれるが、ラーマーら (2019) でははっきりと内肛動物との単系統性を示すため、これを反映した。また、ギリベ (2016) における系統仮説では苔虫動物と内肛動物が姉妹群をなすが、ラーマーら (2019) では苔虫動物と箒虫動物が姉妹群となり、それに腕足動物を加えた単系統群（lophophorate clade[159]、触手冠動物[11]）が強く支持され、内肛動物はそれと姉妹群をなす結果はあるもののそうでない結果もあることから、ラーマーら (2019) の系統樹を優先して変更した。
^ 前口動物内での位置は未確定[11][158] だが、吸啜動物に近縁[160] または環形動物に内包される[161] という結果がある。
^ a b c 螺旋動物は冠輪動物と呼ばれる事もある[11]。その場合本項の系統樹に登場する冠輪動物は担輪動物と呼び変えられる[11]
^ 2000年代の一部の分子系統解析（Giribet et al. (2001) など）では、ウミグモ類は真鋏角類と大顎類（ともに幹性類 Cormogonida をなす）より早期に分岐したとされる[207]。
^ Sharma & Ballesteros (2019) などの分子系統解析により、クモガタ類はカブトガニ類に対して多系統の可能性が示唆される[207]。
^ a b c この系統位置は2010年代中期以降の主流な解析結果（Oakley et al. (2013)、Schwentner et al. (2017, 2018)、Lozano-Fernandez et al. (2019) など）に基づくものである。それ以前の Regier et al. (2005, 2010) では鰓脚類は多甲殻類とともに真甲殻類 Vericrustacea、カシラエビ類はムカデエビ類とともに奇エビ類 Xenocarida をなしている[207][209]。
^ ただし、螺旋動物のうち、触手冠動物の腕足動物などでは放射卵割を行い[75]、脱皮動物でも線形動物のように螺旋卵割を行うものも存在する[221]。かつては前口動物の持つ形質だとみなされていたが、おそらく螺旋動物の持つ共有派生形質である[75]。
^ 例外も多く、例えば尾索動物では後口動物ながら真体腔は裂体腔的に生じる。
^ ドリオラリア幼生（ウミユリ、ナマコ）、オーリクラリア幼生（ナマコ）、ビピンナリア幼生（ヒトデ）、オフィオプルテウス幼生（クモヒトデ）、プルテウス幼生（エキノプルテウス、ウニ）などがあり、ドリオラリア型やオーリクラリア型のものが原始的であると考えられている
種名
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ドブネズミ
都会のネズミ
狐の嫁入り
ネズミの嫁入り
ハチドリ
虎
烏 カラス
アイアイ
鳶
京馬
狐 エノキックコス エキコック
ナカムラ
コバヤシ