ヒト糞便中のウイルスおよび細菌群集の動的性質

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論文|オンライン公開中, 108778
ヒト糞便中のウイルスおよび細菌群集の動的性質

https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(23)02855-9

アンドレイ・N・シュコポロフ
オラ・オレガン
リンダ・スミス
ロレイン・A・ドレイパー
R. ポール・ロス
コリン・ヒル
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オープンアクセス掲載:2023年12月29日DOI:https://doi.org/10.1016/j.isci.2023.108778

ハイライト

生体外培養中にヒトの糞便中バクテリオームとビロームに有意な変化が起こる。

特定のファージと細菌の動態はマイクロバイオームの状況に依存する

プレボテラ菌群の崩壊は、プレボテラ菌ファージの増加によって反映される。

糞便微生物叢のインキュベーションは、腸内細菌型の切り替えに匹敵する変化をもたらしうる。
概要
バクテリオファージは腸内細菌叢の主要な構成要素であり、分類学的および機能的多様性に影響を与えることによって、微生物群集の確立と安定化に役割を果たしていると考えられている。我々は、溶菌性ファージおよび温帯性ファージの活性が、大腸長期滞留モデルにおいて細菌群集構造にも有意な影響を及ぼす可能性があることを示した。ヒトの新鮮な糞便をホモジナイズせずに37℃で嫌気培養し、メタゲノムシークエンシングを行った。その結果、一部の個体において、特定のバクテリオファージおよび細菌集団の、個体特異的な増殖と崩壊が観察された。最も顕著であったのは、特定のバクテリオファージの増加を伴うプレボテラ（Prevotella）集団の顕著な崩壊であった。また、48時間以内に1つの細菌「腸型」から別の細菌「腸型」への移行が観察された例も多数あった。これらの結果は、無傷の糞便が非常に動的な生態系であることを確認し、バクテリオファージによる大きな影響を含め、大腸の滞留時間がマイクロバイオームの構成に大きな影響を及ぼす可能性を示唆している。
図抄録
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キーワード
腸内マイクロバイオーム
バクテリオファージ
大腸内滞留時間
生体外モデル
プレボテラ
クラッスウイルス科
マイクロウイルス科
論文情報
発表履歴
受理された： 2023年12月22日
改訂版受理 2023年11月20日
受理：2023年11月20日 受理：2023年11月15日
出版段階
インプレス, 受理原稿
識別
DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2023.108778

著作権
© 2023
ユーザーライセンス
クリエイティブ・コモンズ 表示 - 非営利 - 改変禁止 (CC BY-NC-ND 4.0) | 情報アイコンの再利用方法
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