西オーストラリア州における再発性Clostridioides difficile感染症のゲノム疫学と伝播ダイナミクス

2023年3月21日 18:34

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36940050/

ダニエル・R・ナイトら、Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2023.
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クロストリジオイデスディフィシル感染症の再発（rCDI）は、CDIの管理において最も一般的かつ深刻な課題の1つであることに変わりはありません。再発（同菌株による感染）と再感染（新菌株による感染）を正確に区別することは、感染管理・予防や患者の治療に影響を及ぼします。ここでは、西オーストラリア州のrCDI患者38人から分離された94株のC. difficileの疫学を全ゲノム配列決定により調査した。C. difficile株集団は、ST2（PCRリボタイプ（RT）014、36.2％）、ST8（RT002、19.1％）、ST34（RT056、11.7％）を筆頭に13種類の配列タイプ（ST）で構成されていた。コアゲノムSNP（cgSNP）タイピングの結果，初発例と再発例の27株（71％）が2cgSNP以下の差で，初発株への感染の再発を示唆し，8株は3cgSNP以上の差で，再感染を示唆した．WGSによってCDIの再発が確認された患者のほぼ半数は、rCDIを定義するために広く用いられている8週間のカットオフ期間外に発症したエピソードであった。疫学的に無関係な患者間での推定菌株伝播イベントがいくつか確認された。rCDI症例および環境由来のSTs 2および34の分離株は、最近の進化史を共有しており、共通のコミュニティリザーバーの可能性を示唆していた。STs2および231によるrCDIエピソードの一部では、ホスト内の菌株の多様性が観察され、moxifloxacin耐性の喪失/獲得が特徴的であった。ゲノミクスにより、再発と再感染の識別が向上し、rCDI患者における推定菌株伝播イベントが特定された。再発のタイミングに基づく再発と再感染の定義については再考が必要である。
キーワード Clostridioides difficile、分子疫学、再発、再感染、再燃、伝染。
© 2023. 著者（複数可）。
参考文献
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