複雑な細菌群集の防御系

複雑な細菌群集の防御系

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.08.12.553040v1

View ORCID ProfileAngelina Beavogui, Auriane Lacroix, Nicolas Wiart, View ORCID ProfileJulie Poulain, View ORCID ProfileTom O. Delmont, View ORCID ProfileLucas Paoli, View ORCID ProfilePatrick Wincker, View ORCID ProfilePedro H. Oliveira
doi: https://doi.org/10.1101/2023.08.12.553040
この論文はプレプリントであり、査読による認証を受けていない［これはどういう意味か？］
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要旨
細菌は、ウイルスやその他の遺伝的寄生体の急速な進化と交代に対応して、感染や殺傷を回避するための様々な防御機構を発達させてきた。このような汎免疫系（またはディフェンソーム）には、感染回避、CRISPR-Cas、制限修飾など、よく研究されている自然免疫系や適応免疫系だけでなく、そのメカニズムがまだ十分に解明されていない新たに発見された免疫系も含まれる。完全なゲノムや培養可能なゲノムでは、防御系の存在量や分布はよく知られているが、複雑な微生物群集における防御系の多様性や豊富さについての理解は不足している。本研究では、土壌、海洋、ヒトの腸内環境から再構築した7,759の高品質細菌集団ゲノムのディフェンソームについて、大規模で詳細な解析を行った。その結果、生活様式、ゲノムサイズ、生息環境、地理的背景と相関する、ディフェンソームの頻度と性質が、大きな系統間で大きく異なることが観察された。ディフェンソームの遺伝的可動性、ディフェンスアイランドへの集積、遺伝的可変性は、細菌システム特異的であり、細菌環境によって形成されることがわかった。したがって、今回の研究結果は、環境的に異なる細菌群集に存在する複数の免疫バリアに関する詳細な情報を提供し、未培養微生物間の多様化に関する斬新で独創的な戦略の同定につながるものである。

利益相反声明
著者らは、競合する利益はないと宣言している。

著作権 本プレプリントの著作権者は著者/資金提供者であり、bioRxivに本プレプリントを永続的に表示するライセンスを許諾している。CC-BY-NC-ND 4.0国際ライセンスの下で利用可能です。
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2023年8月12日掲載
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