Neocallimastix californiae G1がサンタバーバラ動物園のヤギから分離された。
Neocallimastix californiae G1がサンタバーバラ動物園のヤギから分離された。
https://mycocosm.jgi.doe.gov/Neosp1/Neosp1.home.html
Neocallimastix californiae G1は、嫌気性腸内細菌の分離株で、自由生活菌の中で最も早く分岐した門であるNeocallimastigomycotaに属しています。ミトコンドリアを持たず（代わりにヒドロゲノソームを持つ）、鞭毛のある胞子を作って無性に繁殖する、偏性嫌気性菌類である。その生活環は、ツボカビの仲間に似ている。腸内細菌（Neocallimastigomycetes）は、反芻動物や後腸発酵動物などの大型草食動物の腸内微生物群集の一員であり、植物原料をコロニー形成して分解を開始する主要な微生物である。腸内細菌は、これらの動物の糞便から分離され、嫌気性ラボ培養で維持することができ、前処理なしでバイオマスを分解することができ（Haitjemaら、2014）、それらが生成するバイオマス分解酵素のために重要なバイオテクノロジーに関心があります。
Neocallimastix californiae G1は、Santa Barabara Zooのヤギの糞から分離されました。この真菌の分離株は、真菌の進化的研究と応用的研究の両方において特に興味深いものである。このゲノムは、リグノセルロース系バイオ燃料やその他の付加価値化学物質の生産に必要な、新規バイオマス分解酵素の発見を支援します。さらに、このゲノムは、将来的にOMICsに基づくこれらの生物の特性解析を可能にし、そのユニークなオルガネラやバイオマス分解酵素複合体に関する洞察を含む。
参考文献
Haitjema CH, Solomon KV, Henske JK, Theodorou MK, O'Malley MA. 2014. 嫌気性腸内真菌。Advances in isolation, culture, and cellulolytic enzyme discovery for biofuel production. Biotechnol. Bioeng. 111:1471-1482.
ゲノムの参考文献
このゲノムのデータを研究に使用する場合は、以下の出版物を引用してください。
Haitjema CH, Gilmore SP, Henske JK, Solomon KV, de Groot R, Kuo A, Mondo SJ, Salamov AA, LaButti K, Zhao Z, Chiniquy J, Barry K, Brewer HM, Purvine SO, Wright AT, Hainaut M, Boxma B, van Alen T, Hackstein JHP, Henrissat B, Baker SE, Grigoriev IV, O'Malley MA
比較ゲノム解析で明らかになった真菌類セルロソームのパーツリスト。
Nat Microbiol. 2017 May 30;2():17087. doi: 10.1038/nmicrobiol.2017.87
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