過去8年間の抗生物質使用と腸内細菌叢組成

2024年10月16日 11:13

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過去8年間の抗生物質使用と腸内細菌叢組成

View ORCID ProfileGabriel Baldanzi, Anna Larsson,View ORCID ProfileSergi Sayols-Baixeras,View ORCID ProfileKoen F Dekkers, Ulf Hammar,View ORCID ProfileDiem Nguyen,View ORCID ProfileTíscar Graells, Shafqat Ahmad, Camila Gazolla Volpiano,View ORCID ProfileGuillaume Meric、 Josef D Järnhult, Thomas Tängdén,View ORCID ProfileJonas F Ludvigsson, Lars Lind,View ORCID ProfileJohan Sundström,View ORCID ProfileKarl Michaëlsson,View ORCID ProfileJohan Ärnlöv,View ORCID ProfileBeatrice Kennedy, Marju Orho-Melander,View ORCID ProfileTove Fall

doi:https://doi.org/10.1101/2024.10.14.24315441

この論文はプレプリントであり、査読の認証を受けていません。まだ評価されていない新しい医学研究を報告しているため、臨床診療の指針として使用すべきではありません。

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要旨

背景腸内細菌叢の乱れは、心代謝疾患やその他の健康転帰に関与している。抗生物質は腸内細菌叢の撹乱因子として知られているが、腸内細菌叢の分類学的組成に対する長期的な影響についてはまだ十分に検討されていない。方法我々は、スウェーデンの集団ベースの研究SCAPIS、MOS、SIMPLERの成人15,131人を対象に、8年間にわたる登録ベースの経口抗生物質使用と、糞便ショットガン・メタゲノミクスで評価した腸内細菌叢組成との関連を調査した。糞便サンプリング前のあらかじめ指定した3つの期間（1年未満、1～4年、4～8年）における処方回数を主要な曝露として多変量回帰モデルを適用し、社会人口統計学、ライフスタイル、合併症で調整した。二次解析では、抗生物質を1コースのみ使用した参加者、または全く使用しなかった参加者を対象とした。結果糞便サンプリングの1年未満前の抗生物質の使用は、腸内細菌叢の種の多様性の最大の減少と関連していたが、1～4年前および4～8年前の抗生物質の使用も多様性の減少と関連していた。クリンダマイシン、フルオロキノロン系抗菌薬、フルクロキサシリンは、すべての期間において抗生物質の使用と個々の種の存在量との関連性のほとんどを占めていた。これら3種の抗生物質の4～8年前の使用は、調査した種の10～14％の存在量の変化と関連していた。ペニシリンV、スペクトル延長ペニシリン、ニトロフラントインの使用は、わずか数種の存在量の変化と関連していた。同様の結果は、サンプリングの4～8年前に抗生物質が1コース処方された場合と、過去8年間に1コースも処方されなかった場合を比較した場合にも認められた。結論クリンダマイシン、フルオロキノロン、およびナロースペクトラムのフルクロキサシリンのような一般的に処方される抗生物質は、腸内細菌叢に長期にわたる影響を及ぼすようである。

利益相反声明

J.S. Bayer、Boehringer、Eli Lilly、Gilead、GSK、Göteborg University、Itrim、Ipsen、Janssen、Karolinska Institutet、LIF、Linköping University、Novo Nordisk、Parexel、Pfizer、Region Stockholm、Region Uppsala、Sanofi、STRAMA、武田薬品、TLV、Uppsala University、Vifor Pharma、WeMindなど。J.Ä.はAstella、AstraZeneca、Boehringer Ingelheimの諮問委員を務めており、AstraZenecaとNovartisから講演料を受け取っている。また、J.F.L.は、M.S.D.から中国の国家医療登録のレビュー論文を作成するための財政的支援を受けており、M.S.D.とは無関係のIBD研究について継続的に協議しており、武田薬品からセリアック病研究のための資金援助を受けている。また、武田薬品からセリアック病の研究助成を受けている。残りの著者は、競合する利益はないと宣言している。

資金提供

欧州研究評議会［ERC-STG-2018-801965（T.F.）；ERC-CoG-2014-649021（M.O.-M.）；ERC-STG-2015-679242（J.G.S.）］、スウェーデン心肺財団［Hjärt-Lungfonden, 2019-0505（T.F.）；2018-0343（J.Ä.）；20120-0711（M.O.-M. M.）］、スウェーデン研究評議会［VR, 2019-01471 (T.F.), 2018-02784 (MO-M), 2018-02837 (M.O.-M.), 2019-01015 (J.Ä.), 2020-00243 (J.Ä.), 2022-01460 (S.A.), and EXODIAB 2009-1039 (M.O.-M.). M.O.-M.）］、スウェーデン持続可能な開発のための研究評議会［FORMAS、2020-00989（S.A.）］、Göran Gustafsson財団［2016（T.F.）］、Axel and Signe Lagerman's foundation（T.F.）、A.L.F.政府助成金2018-0148（M.O.-M.）、ノボ・ノルディック財団NNF20OC0063886（M.O.-M. M.）、The Swedish Diabetes Foundation DIA 2018-375（M.O.-M.）、Center of Clinical Research (CKF) in Region Dalarna（J.Ä.）、Epihealth（S.A.）、Swedish National Health Service（J.G.S.）内の臨床研究の政府助成金。B.K.は、ウプサラ大学病院のGullstrandフェロー助成金の支援を受けている。SCAPISの主な助成団体であるSwedish Heart-Lung Foundationに謝意を表する。SCAPIS研究の資金は、Knut and Alice Wallenberg財団、Swedish Research CouncilおよびVINNOVA（スウェーデンのイノベーション機関）、イェーテボリ大学およびSahlgrenska大学病院、カロリンスカ研究所およびストックホルム県議会、Link&oumlping大学および大学病院、Lund大学およびSkåne大学病院、Umeå大学および大学病院、Uppsala大学および大学病院からも提供された。SIMPLERの設備と実験支援、Anna-Karin KolsethとNiclas Håkanssonの協力に感謝する。SIMPLERはSwedish Research Councilから助成金（助成番号2017-00644、2017-06100、2021-00160）およびStiftelsen Olle Engkvist Byggmästareを受けている。計算とデータの取り扱いは、スウェーデン研究評議会から助成金契約番号2022-06725を通じて資金提供を受けているウプサラ先端計算科学学際センター（UPPMAX）のスウェーデン国立スーパーコンピューティング基盤（NAISS）が提供するプロジェクトsens2019512とsimp2023007のリソースを利用した。

著者宣言

私は、関連するすべての倫理指針が遵守され、必要なIRBおよび/または倫理委員会の承認が得られたことを確認します。

はい

記載された研究に対して承認または免除を与えた IRB/監督機関の詳細を以下に示す：

倫理的承認は、スウェーデン倫理審査機関から得た（DNR 2018-315 Bおよび修正2020-06597および2022-06460-02、DNR 2012-594および修正2017-768および2020-05611、DNR 2022-06137-01および修正DNR 2023-04785-02）。3つの研究の参加者全員が、書面によるインフォームド・コンセントを提供した。

私は、必要なすべての患者／参加者の同意が得られ、適切な機関書式が保管されていること、および含まれる患者／参加者／試料の識別情報が、研究グループ以外の者（例えば、病院スタッフ、患者または参加者自身）には知られず、個人を特定するために使用できないことを確認します。

はい

すべての臨床試験およびその他の前向き介入研究は、ClinicalTrials.govのようなICMJE承認の登録機関に登録されなければならないことを理解します。私は、原稿で報告されたそのような試験が登録されていること、および試験登録IDが提供されていることを確認します（注：遡及的に登録された前向き試験を投稿する場合は、試験ID欄にその試験が事前に登録されなかった理由を説明する文を記入してください）。

はい

関連するEQUATORネットワークの研究報告チェックリストやその他の関連資料（該当する場合）など、すべての適切な研究報告ガイドラインに従った。

はい

著作権

このプレプリントの著作権者は著者/資金提供者であり、medRxiv にプレプリントを永続的に表示するライセンスを付与しています。CC-BY 4.0国際ライセンスの下で利用可能です。

bioRxivおよびmedRxivは、以下の寛大な資金援助に感謝します：

Chan Zuckerberg Initiative、Cold Spring Harbor Laboratory、Sergey Brin Family Foundation、California Institute of Technology、Centre National de la Recherche Scientifique、Fred Hutchinson Cancer Center、Imperial College London、Massachusetts Institute of Technology、Stanford University、University of Washington、Vrije Universiteit Amsterdam。

2024年10月15日掲載

印刷/保存オプション

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