計算・システムバイオロジー微生物学・感染症ネットワークベースのマルチオミクス統合により、治療中のHIV感染症における代謝的なアットリスクプロファイルが明らかになった

研究論文
計算・システムバイオロジー微生物学・感染症
ネットワークベースのマルチオミクス統合により、治療中のHIV感染症における代謝的なアットリスクプロファイルが明らかになった

https://elifesciences.org/articles/82785

Flora Mikaeloff 対応する著者である et al.
2023年2月16日
https://doi.org/10.7554/eLife.82785

ダウンロード
引用
コメント
共有
記事
図表・データ
概要
マルチオミクス技術により、抗レトロウイルス療法を受けているHIV感染者（PLWH）の健康状態に関する生物学的な理解が進んでいる。しかし、長期的な治療が成功した際の代謝リスクプロファイルの体系的かつ詳細な特徴づけはまだ行われていない。ここでは、マルチオミクス（血漿リピドミクス、メタボローム、糞便16Sマイクロバイオーム）データ駆動型の層別化と特徴づけを行い、PLWH内の代謝性リスクプロファイルを特定しました。ネットワーク解析と類似ネットワーク融合（SNF）により、健康（HC）様（SNF-1）、軽度アトリスク（SNF-3）、重度のアトリスク（SNF-2）の3つのPLWHグループ（SNF-1から3）を同定した。SNF-2のPLWH（45％）は、他の2つのクラスターよりもCD4+T細胞数が多いにもかかわらず、内臓脂肪組織の増加、BMI、メタボリックシンドローム（MetS）の高い発生率、ジおよびトリグリセリドの増加という重度のアトリスク代謝プロファイルを有していた。しかし、HC様群および重症リスク群は、HIV陰性対照群（HNC）とは異なる同様の代謝プロファイルを有し、アミノ酸代謝の調節異常が見られた。マイクロバイオームプロファイルでは、HC様群ではα多様性が低く、男性と性交渉を持つ男性（MSM）の割合が低く、Bacteroidesに富むことが示された。一方、アットリスク群では、プレボテラが増加し、MSMの割合が高く、全身性の炎症が強くなり、心代謝系リスクプロファイルが増加する可能性があることがわかりました。また、マルチオミクス統合解析により、PLWHにおける微生物由来の代謝物の複雑な相互作用が明らかになりました。これらの重篤なリスクを持つクラスターは、個別化医療やライフスタイルへの介入により、代謝異常形質を改善し、より健康的な加齢を目指すことができると考えられる。

コメントを追加する
データの入手方法

論文・著者情報

カテゴリーとタグ
研究論文計算科学・システムバイオロジー微生物・感染症
研究対象生物
ウイルス
副読本
計算機生物学・システム生物学
老化した組織で転写ノイズが増加したことを示す証拠はない
オルガ・イバニェス-ソレ、アレックス・M・アセンション... アンデル・イゼタ
研究論文 2023年2月16日更新
計算科学・システムバイオロジー 神経科学
成熟したマウスの青斑核の細胞構成と回路構成
アンドリュー・マッキニー、ミン・フー ... 姜 暁龍
研究論文 2023年2月16日更新
計算・システム生物学 発生生物学
体積電子顕微鏡における細胞型、組織、臓器の教師なし探索のためのMorphoFeatures
ヴァレンティナ・ジンチェンコ、ヨハネス・ハガー... アンナ・クレシュク
ツール・リソース 2023年2月16日
eLifeの新しい記事をいち早く読む
メールアラートに登録する
プライバシーポリシー
ハワード・ヒューズ医学研究所
ウエルカムトラスト
マックス・プランク研究機構
クヌート＆アリス・ワレンバーグ財団
会社概要
ジョブズ
協力企業
アラート
連絡先
取引条件
個人情報保護方針
インサイドエリ-フ
マンスリーアーカイブス
プレス向け
リソース
XMLとデータ

Githubで私たちを見つける
Positive Planet - カーボンニュートラル認証
eLifeは、研究資金提供者に触発され、科学者が率いる非営利団体です。私たちの使命は、科学における最も責任ある行動を奨励・評価する研究コミュニケーションのためのプラットフォームを運営し、科学者が発見を加速できるよう支援することです。
eLife Sciences Publications, Ltdは、米国デラウェア州で法人化された有限責任非営利非株式会社で、会社番号は5030732、英国では会社番号FC030576、支店番号BR015634で住所に登録されています。
eLife Sciences Publications, Ltd.
ウェストブルックセンター、ミルトンロード
ケンブリッジ CB4 1YG
英国
2023 eLife Sciences Publications Ltd. © 2023 eLife Sciences Publications Ltd. 特に断りのない限り、クリエイティブ・コモンズ表示ライセンスに従います。ISSN: 2050-084X