胎児マイクロバイオームへの疑問は、低バイオマス微生物研究の落とし穴を示す


掲載:2023年1月25日
胎児マイクロバイオームへの疑問は、低バイオマス微生物研究の落とし穴を示す
キャサリン・M・ケネディ、マーカス・C・デ・ゴッファウ、...イェンス・ウォルター 著者紹介を表示する
Nature volume 613, pages639-649 (2023)この記事を引用する

138 Altmetric

メトリクス詳細

概要
健康な妊娠において、ヒトの胎児と出生前の子宮内環境(羊水と胎盤)が微生物群によって安定的にコロニー化されているかどうかは、依然として議論の対象である。ここでは、生殖生物学、微生物生態学、バイオインフォマティクス、免疫学、臨床微生物学、グノバイオロジーの観点から、ヒト胎児の微生物集団を特徴付けた最近の研究を評価し、胎児が微生物と相互作用する可能性のあるメカニズムについて評価する。その結果、検出された微生物シグナルは、胎児サンプルを得るための臨床処置中、あるいはDNA抽出およびDNA配列決定中の汚染の結果である可能性が高いことがわかりました。さらに、健康な胎児組織に生きた複製可能な微生物集団が存在することは、免疫学、臨床微生物学、無菌哺乳類の誘導の基本概念と相容れないものである。これらの結論は、ヒトの免疫発達を理解する上で重要であり、他の多くの低バイオマス環境の微生物分析に共通する落とし穴を示している。胎児のマイクロバイオームを追求することは、バイオマスが少ない、あるいは存在しない場合のシーケンスベースのマイクロバイオーム研究の難しさを示す注意すべき例となり、生物学、生態学、機構学の概念を取り入れることで、汚染管理を超えた学際的アプローチの必要性を強調するものである。


参考文献
Macpherson, A. J., de Aguero, M. G. & Ganal-Vonarburg, S. C. How nutrition and the maternal microbiota shape the neonatal immune system(栄養と母親の微生物叢が新生児の免疫系をどのように形成するか)。Nat. Rev. Immunol. 17, 508-517 (2017).

論文

キャス

Google Scholar

Kalbermatter, C., Fernandez Trigo, N., Christensen, S. & Ganal-Vonarburg, S. C. Maternal microbiota, early life colonization and breast milk drive immune development in the newborn.母体微生物叢、生後間もないコロニー形成と母乳が新生児の免疫発達を促進する。Front. Immunol. 12, 683022 (2021).

論文

CAS

Google Scholar

Gensollen, T., Iyer, S. S., Kasper, D. L. & Blumberg, R. S. How colonization by microbiota in early life shapes the immune system.(幼少期の微生物叢によるコロニー形成はどのように免疫系を形成するか)。サイエンス 352, 539-544 (2016).

論文紹介

ADS

キャス

Google Scholar

Jain, N. The early life education of the immune system: moms, microbes and (missed) opportunities. Gut Microbes 12, 1824564 (2020).

論文

Google Scholar

Hornef, M. W. & Torow, N.「層状免疫」と「新生児の機会の窓」-出生後の粘膜宿主-微生物恒常性確立のための非冗長相の時限的連続性。Immunology 159, 15-25 (2020).

論文

CAS

Google Scholar

Torow, N., Marsland, B. J., Hornef, M. W. & Gollwitzer, E. S. Neonatal mucosal immunology(新生児粘膜免疫学). Mucosal Immunol. 10, 5-17 (2017).

論文

キャス

Google Scholar

Schreurs, R. et al. Human fetal TNF-α-cytokine-producing CD4+ effector memory T cells promote intestinal development and mediate inflammation early in life.ヒト胎児TNF-α-cytokine産生CD4+エフェクターメモリーT細胞は、腸の発達を促進し、生後早期に炎症を引き起こす。Immunity 50, 462-476 (2019).

論文

キャス

Google Scholar

Stras, S. F. et al. Human intestinal immune systemの成熟は、胎児期の発達の初期に起こる。Dev. Cell 51, 357-373 (2019).

論文

キャス

Google Scholar

Zhang, X. et al. エフェクターメモリーの表現型と機能を持つCD4 T細胞は、胎児の無菌環境下で発生する。Sci. Transl. Med. 6, 238ra272 (2014) に掲載されました。

論文

Google Scholar

Tissier, H. Recherches sur la flore intestinale des nourrissons: (état normal et pathologique).博士論文、BIU Santé (1900). 博士論文、BIU Santé (1900).

He, Q. et al. メコニウムの微生物叢は、母親の糞便および膣の微生物叢よりも羊水の微生物叢と多くの特徴を共有している。Gut Microbes 12, 1794266 (2020).

論文

Google Scholar

Stinson, L. et al.早産と期産の中間期羊水サンプルにおける細菌DNAプロファイルの比較。Front. Microbiol. 11, 415 (2020).

論文

Google Scholar

Younge, N. et al. Fetal exposure to the maternal microbiota in humans and mice.ヒトとマウスにおける母親の微生物叢への胎児曝露。JCI Insight 4, e127806 (2019).

論文

Google Scholar

Stinson, L. F., Boyce, M. C., Payne, M. S. & Keelan, J. A. The not-so-sterile womb: evidence that the human fetus is exposed to bacteria prior to birth.(無菌でない子宮:ヒト胎児が出生前に細菌に曝露される証拠)。Front. Microbiol. 10, 1124 (2019).

論文

Google Scholar

Aagaard, K. et al. The placenta harbors a unique microbiome. Sci. Transl. Med. 6, 237ra265 (2014).

Google Scholar

D'Argenio, V. The prenatal microbiome: a new player for human health(出生前マイクロバイオーム:ヒトの健康のための新しいプレーヤー)。ハイスループット 7, 38 (2018).

論文

Google Scholar

Funkhouser, L. J. & Bordenstein, S. R. Mom knows best: the universality of maternal microbial transmission(ママはベストを知っている:母親の微生物伝播の普遍性)。PLoS Biol. 11, e1001631 (2013).

論文

CAS

Google Scholar

Stinson, L. F., Payne, M. S. & Keelan, J. A. Planting the seed: origins, composition, and postnatal health significance of the fetal gastrointestinal microbiota.(種を植える:胎児消化管微生物叢の起源、組成、出生後の健康上の意義). Crit. Rev. Microbiol. 43, 352-369 (2017).

論文

キャス

Google Scholar

Walker, R. W., Clemente, J. C., Peter, I. & Loos, R. J. F. The prenatal gut microbiome: Are we colonized with bacteria in the utero? 小児科医。Obes. 12 (Suppl. 1), 3-17 (2017)に掲載されています。

論文

Google Scholar

Bolte, E. E., Moorshead, D. & Aagaard, K. M. Maternal and early life exposures and their potential to influence development of the microbiome.(母体および幼少期の暴露とマイクロバイオームの発達に影響を及ぼす可能性)。Genome Med. 14, 4 (2022).

論文

Google Scholar

Berg, G. et al. Microbiome definition re-visited: old concepts and new challenges. Microbiome 8, 103 (2020)。

論文

Google Scholar

Blaser, M. J. et al.出生前マイクロバイオーム論争からの教訓。マイクロバイオーム 9, 8 (2021)。出生前マイクロバイオーム論争について、マイクロバイオーム分野の複数の専門家による議論。

論文

Google Scholar

Bushman, F. D. De-discovery of the placenta microbiome(胎盤マイクロバイオームの脱発見)。Am. J. Obstet. Gynecol. 220, 213-214 (2019).

論文

Google Scholar

エディトリアル マイクロバイオーム研究と「ヒマラヤのシロナガスクジラ」。Lancet Infect. Dis. 18, 925 https://doi.org/10.1016/S1473-3099(18)30503-6 (2018).

Hornef, M. & Penders, J. Does a prenatal bacterial microbiota exist? Mucosal Immunol. 10, 598-601 (2017).

論文紹介

キャス

Google Scholar

Perez-Muñoz, M. E., Arrieta, M. C., Ramer-Tait, A. E. & Walter, J. A critical assessment of the "sterile womb" and "in utero colonization" hypotheses: implications for research on the pioneer infant microbiome.ペレス-ムニョス、M. E., アリエッタ、M. C. & ウォルター、J. "無菌子宮 "仮説の批判的評価。マイクロバイオーム 5, 48 (2017).

論文

Google Scholar

Segata, N. 健康な胎盤に細菌は発見されていない。ネイチャー 572, 317-318 (2019).

記事

ADS

キャス

グーグル・スカラー

Walter, J. & Hornef, M. W. A philosophical perspective on the prenatal in utero microbiome debate(出生前の子宮内マイクロバイオーム論争に関する哲学的視点)。マイクロバイオーム 9, 5 (2021).

論文

Google Scholar

de Goffau, M. C. et al. Human placenta has no microbiome but can contain potential pathogens.ヒト胎盤にはマイクロバイオームが存在しないが、潜在的な病原体が存在する可能性がある。ネイチャー 572, 329-334 (2019)。ロバストコントロールを用いたシーケンス研究、胎盤のマイクロバイオームの証拠はないと結論付けている。

論文

ADS

グーグルスカラー

Kennedy, K. M. et al. Fetal meconium does not have a detectable microbiota before birth.(胎児メコニウムは出生前に検出可能なマイクロバイオータを持たない)。Nat. Microbiol. 6, 865-873 (2021). 帝王切開後に得られたメコニウムサンプルを用いて、ヒト胎児の微生物集団を特徴付けた、今のところ唯一のシークエンス研究で、微生物叢の証拠はないと結論付けています。

論文紹介

CAS

Google Scholar

Kuperman, A. A. et al. Deep microbial analysis of multiple placentas shows no evidence for a placental microbiome.複数の胎盤の深い微生物分析により、胎盤マイクロバイオームの証拠は得られなかった。BJOG 127, 159-169 (2020).

論文

CAS

Google Scholar

Lauder, A. P. et al. 胎盤サンプルと汚染コントロールの比較は、明確な胎盤マイクロバイオータのエビデンスを提供しない。マイクロバイオーム 4, 29 (2016).

論文

Google Scholar

Leiby, J. S. et al.早産および期産のサンプルにおけるヒト胎盤マイクロバイオームの検出の欠落。マイクロバイオーム6, 196 (2018)。

記事

Google Scholar

Theis, K. R. et al.正期産のヒト胎盤にはマイクロバイオータが存在するか?培養、定量的リアルタイムPCR、16S rRNA遺伝子配列決定、メタゲノミクスの結果。Am. J. Obstet. Gynecol. 220, 267.e1-267.e39 (2019).

論文

キャス

Google Scholar

Sterpu, I. et al. No evidence for a placental microbiome in human pregnancies at term. Am. J. Obstet. Gynecol. 224, 296.e1-296.e23 (2021)に掲載されています。

論文

CAS

Google Scholar

de Goffau, M. C. et al. Recognizing the reagent microbiome. Nat. Microbiol. 3, 851-853 (2018).

論文

Google Scholar

Olomu, I. N. et al. "kitome "と "splashome "の汚染を排除した結果、ユニークな胎盤マイクロバイオームが検出されない。BMC Microbiol. 20, 157 (2020).

論文

CAS

Google Scholar

Salter, S. J. et al. Reagent and laboratory contamination can critically impact sequence-based microbiome analyses.試薬と実験室の汚染は、配列ベースのマイクロバイオーム解析に重大な影響を与える。BMC Biol. 12, 87 (2014)に掲載されています。

論文

Google Scholar

Rackaityte, E. et al. Viable bacterial colonization is highly limited in the human intestine inutero.(子宮内のヒト腸内では、生存可能な細菌のコロニー形成は非常に限られている。Nat. Med. 26, 599-607 (2020). 経膣分娩後に得られた胎児サンプルの微生物学的特性評価、高度に限定された細菌コロニー形成を報告。

論文

CAS

Google Scholar

Mishra, A. et al.ヒトの初期発生における微生物曝露は、胎児の免疫細胞をプライミングする。Cell 184, 3394-3409 (2021)。妊娠第2期の医療的な妊娠終了と経膣分娩後に得られた胎児組織の分析で、胎児の微生物コロニー形成と胎児免疫細胞の細菌プライミングを報告。

論文

CAS

Google Scholar

Li, Y. et al. Inutero human intestine harbors unique metabolomic features including bacterial metabolites. JCI Insight 5, e138751 (2020). 経膣分娩で得られた胎児の微生物叢の特徴、細菌のコロニー形成の証拠がないことを報告。

論文

Google Scholar

Lim, E. S., Rodriguez, C. & Holtz, L. R. 健康な期産妊娠からの羊水は、検出可能な微生物群を保有していない。マイクロバイオーム 6, 87 (2018).

論文

Google Scholar

Liu, Y. et al. Midtrimester amniotic fluid from healthy pregnancies has no microorganisms using multiple methods of microbiologic inquiry.健康な妊娠からの羊水は、複数の微生物学的調査方法を用いて微生物が存在しない。Am. J. Obstet. Gynecol. 223, 248.e1-248.e21 (2020).

論文

CAS

Google Scholar

Rehbinder, E. M. et al. 合併症のない有期妊娠の女性の羊水には細菌がいないのか?Am. J. Obstet. Gynecol. 219, 289.e1-289.e12 (2018)に掲載されています。

論文

Google Scholar

de Goffau, M. C., Charnock-Jones, D. S., Smith, G. C. S. & Parkhill, J. Batch Effect account for the main findings of an in utero human intestinal bacterial colonization study(バッチ効果は胎内ヒト腸内細菌コロニー形成研究の主な知見を説明する。Microbiome 9, 6 (2021).

論文

Google Scholar

耳鼻咽喉科外来患者における非処置器具の微生物汚染。J. Laryngol. Otol. 117, 122-125 (2003).

論文

Google Scholar

Wistrand, C., Soderquist, B. & Sundqvist, A. S. 制御手術室環境における無菌野の時間依存性細菌空気汚染:実験的介入研究。J. Hosp. Infect. 110, 97-102 (2021).

論文

CAS

Google Scholar

Gomez de Aguero, M. et al. The maternal microbiota drives early postnatal innate immune development. サイエンス 351, 1296-1302 (2016)。母体の微生物化合物によって誘導される出生前免疫発達の側面が、胎児に生きた微生物が存在しない場合でも起こりうることを示した研究。

論文

ADS

Google Scholar

Vuong, H. E. et al. 母体マイクロバイオームがマウスの胎児の神経発達を調節する。ネイチャー 586, 281-286 (2020).

論文

ADS

キャス

Google Scholar

Baker, J. M., Chase, D. M. & Herbst-Kralovetz, M. M. Uterine microbiota: residents, tourists, or invaders? Front. Immunol. 9, 208 (2018).

論文

Google Scholar

Cherry, S. H., Filler, M. & Harvey, H. Lysozyme content of amniotic fluid(羊水中のリゾチーム含有量)。Am. J. Obstet. Gynecol. 116, 639-642 (1973).

論文

CAS

Google Scholar

Soto, E. et al. Human β-defensin-2: a natural antimicrobial peptide present in amniotic fluid participates in the host response to the microbial invasion of the amniotic cavity.羊水中に存在する天然の抗菌ペプチドは、羊水腔の微生物侵入に対する宿主反応に関与している。J. Matern. Fetal Neonatal Med. 20, 15-22 (2007).

論文

CAS

Google Scholar

Reichhardt, M. P. et al. 幼少期の唾液スカベンジャーとアグルチニン:羊水と乳児腸管における多様な役割. J. Immunol. 193, 5240-5248 (2014).

論文

CAS

Google Scholar

Sinha, R. et al. Microbiome Quality Control (MBQC) プロジェクトコンソーシアムによる微生物群アンプリコンシーケンスのばらつきの評価. Nat. Biotechnol. 35, 1077-1086 (2017).

論文

キャス

Google Scholar

Grettenberger, C. L. Novel Gloeobacterales spp. from diverse environments across the globe. mSphere 6, e0006121 (2021).「地球上の多様な環境から得られた新規グロエバクテラレス属細菌」。

論文

Google Scholar

ラヴェル、J.ら、生殖年齢女性の膣内マイクロバイオーム。Proc. Natl Acad. Sci. USA 108 (Suppl. 1), 4680-4687 (2011).

論文

ADS

CAS

Google Scholar

メグリ、C. J. & コイン、C. B. 母体・胎児間の感染症:病因と防御の概要。Nat. Rev. Microbiol. 20, 67-82 (2022).

論文

CAS

Google Scholar

B群レンサ球菌の二重生活:無症候性コロニー形成菌と強力な病原体。J. Mol. Biol. 431, 2914-2931 (2019)に掲載されています。

論文

キャス

Google Scholar

Dodd, J. M. & Crowther, C. A. Misoprostol for induction of labor to terminate pregnancy in the second or third trimes for women with a fetal anomaly or after intraxine fetal death(胎児異常のある女性または子宮内胎児死亡後の妊娠を終了させるための陣痛誘発)。Cochrane Database Syst. Rev. 2010, CD004901 (2010).

Google Scholar

Nijman, T. A. et al. ミソプロストールを使用した妊娠終結における感染と発熱の関連性:レトロスペクティブ・コホート研究. BMC Pregnancy Childbirth 17, 7 (2017).

論文

Google Scholar

Rackaityte, E. et al. Corroborating evidence refutes batch effect as explanation for fetal bacteria.「胎児バクテリアの説明としてバッチ効果を否定する裏付けとなる証拠」。マイクロバイオーム 9, 10 (2021)。

記事

CAS

Google Scholar

Duar, R. M. et al. Lifestyles in Transition: Evolution and Natural History of the genus Lactobacillus.(ライフスタイルの変遷:ラクトバチルス属の進化と自然史). FEMS Microbiol. Rev. 41, S27-S48 (2017)に掲載されています。

論文

ADS

グーグル・スカラー

Dominguez-Bello, M. G. et al. Delivery mode shapes the acquisition and structure of the initial microbiota across multiple body habitats in newborns.(出産形態は、新生児の複数の体内生息域における初期微生物叢の獲得と構造を形成する。Proc. Natl Acad. Sci. USA 107, 11971-11975 (2010)に掲載されています。

論文

ADS

Google Scholar

Dos Santos, S. J. et al. Early neonatal meconium does not have a demonstrable microbiota determined through use of robust negative controls with cpn60-based microbiome profiling. Microbiol. Spectr. 9, e0006721 (2021).

論文

Google Scholar

Heida, F. H. et al. 体重は早産児の腸内細菌叢を形成する:前向き観察研究の結果。BMC Microbiol. 21, 219 (2021).

論文

CAS

Google Scholar

Backhed, F. et al. Dynamics and stabilization of the human gut microbiome during the first year of life.(生後1年間のヒト腸内細菌群の動態と安定化)。Cell Host Microbe 17, 690-703 (2015).

論文

Google Scholar

Shao, Y. et al. Stunted microbiota and opportunistic pathogen colonization in caesarean section birth(帝王切開出産における微生物叢と日和見病原体のコロニー形成)。ネイチャー 574, 117-121 (2019).

論文

ADS

キャス

グーグル・スカラー

Podlesny, D. & Fricke, W. F. Strain inheritance and neonatal gut microbiota development: a meta-analysis.ポドレスニー、D. & Fricke, W. F. Strain inheritance and neonatal gut microbiota development: メタアナリシス。Int. J. Med. Microbiol. 311, 151483 (2021).

論文

CAS

Google Scholar

Bajorek, S. et al.出生直後の新生児胃の初期微生物群集. Gut Microbes 10, 289-297 (2019).

論文

キャス

Google Scholar

Kim, S. M. et al. Ureaplasma種による羊水内感染の同定のための胃液対羊水分析. J. Matern. Fetal Neonatal Med. 29, 2579-2587 (2016).

キャス

グーグル スカラー

Martin, R. et al. 出産形態や授乳の種類、兄弟姉妹、性別などの早世の出来事が、発達中の腸内細菌叢を形成する。PLoS One 11, e0158498 (2016).

論文

Google Scholar

Yassour, M. et al. 幼児の腸内細菌叢の自然史および抗生物質治療が細菌株の多様性と安定性に及ぼす影響。Sci. Transl. Med. 8, 343ra381 (2016).

論文

Google Scholar

Mitchell, C. M. et al. Delivery mode affects stability of early infant gut microbiota.(出産形態は、早期乳児の腸内細菌叢の安定性に影響を及ぼす。セル・リップ・メド. 1, 100156 (2020).

論文

キャス

Google Scholar

Ferretti, P. et al. 母子間の異なる身体部位からの微生物伝播は、発達中の乳児の腸内細菌叢を形成する。Cell Host Microbe 24, 133-145 (2018).

記事

キャス

Google Scholar

Yassour, M. et al. Strain-level analysis of mother-to-child bacterial transmission during the first few months of life.(生後数カ月間の母子間細菌伝播の菌株レベルの分析)。Cell Host Microbe 24, 146-154 (2018).

論文

キャス

Google Scholar

Korpela, K.ら、帝王切開で生まれた乳児への母体糞便微生物叢移植は、正常な腸内微生物の発達を迅速に回復させる:概念実証研究(Proof-of-concept study)。Cell 183, 324-334 (2020).

論文

CAS

Google Scholar

Davis, N. M., Proctor, D. M., Holmes, S. P., Relman, D. A. & Callahan, B. J. マーカー遺伝子およびメタゲノミクスデータにおける汚染配列の簡単な統計的識別と除去。マイクロバイオーム 6, 226 (2018).

論文

Google Scholar

Dyrhovden, R. et al. Managing contamination and diverse bacterial loads in 16S rRNA deep sequencing of clinical samples: implications of the law of small numbers. mBio 12, e0059821 (2021).「臨床サンプルの16S rRNAディープシーケンスにおける汚染と多様な細菌負荷の管理」。

論文

Google Scholar

Laurence, M., Hatzis, C. & Brash, D. E. Common contaminants in next-generation sequencing that hinder discovery of low abundance microbes(次世代シーケンシングにおける低濃度微生物の発見を妨げる共通の汚染物質)。PLoS One 9, e97876 (2014).

論文

ADS

Google Scholar

Read, S. J. 定量的LightCycler PCRで測定した核酸抽出キットの回収効率. Mol. Pathol. 54, 86-90 (2001).

論文

CAS

Google Scholar

Walker, S. P. et al. ヒトDNAの非特異的増幅は、16S rRNA遺伝子配列解析における大きな課題である。Sci. Rep. 10, 16356 (2020)に掲載されています。

論文

CAS

Google Scholar

Cebra, J. J., Periwal, S. B., Lee, G., Lee, F. & Shroff, K. E. 腸関連リンパ組織(GALT)の発達と維持:腸内細菌とウィルスの役割. Dev. Immunol. 6, 13-18 (1998).

論文

CAS

Google Scholar

Gaboriau-Routhiau, V. et al. 腸管ヘルパーT細胞応答の協調的成熟におけるセグメント化された糸状菌の重要な役割. Immunity 31, 677-689 (2009).

論文

CAS

Google Scholar

Wesemann, D. R. et al. Microbial colonization influences early B-lineage development in the gut lamina propria.(微生物コロニー形成は腸管固有層の初期B線条発生に影響を与える)。Nature 501, 112-115 (2013).

論文

ADS

CAS

Google Scholar

Li, H. et al. 粘膜または全身の微生物叢への暴露がB細胞レパートリーを形成する。Nature 584, 274-278 (2020).

論文

ADS

キャス

Google Scholar

Bacher, P. et al. Human anti-fungal Th17 immunity and pathology rely on crossactivity against Candida albicans.ヒト抗真菌Th17免疫と病理学は、カンジダ・アルビカンスに対する交差反応に依存している。Cell 176, 1340-1355 (2019).

論文

キャス

Google Scholar

Kabbert, J. et al. 成人ヒト腸管IgAの高い微生物反応性には体細胞変異が必要である。J. Exp. Med. 217, e20200275 (2020).

論文

Google Scholar

Arpaia, N. et al.常在菌が産生する代謝産物は、末梢性制御性T細胞の生成を促進する。Nature 504, 451-455 (2013).

論文

ADS

CAS

Google Scholar

McGovern, N. et al. Human fetal dendritic cells promote prenatal T-cell immune suppression through arginase-2. ネイチャー 546, 662-666 (2017).

論文

ADS

キャス

Google Scholar

Rechavi, E. et al. ヒト胎児発生におけるBおよびT細胞レパートリーのタイムリーかつ空間的に制御された成熟(Timely and spatially reguration of B and T cell repertoire during human fetal development). Sci. Transl. Med. 7, 276ra225 (2015)に掲載されています。

論文

Google Scholar

Casas, R. & Bjorksten, B. Detection of Fel d 1-immunoglobulin G immune complexes in cord blood and sera from allergic and non-allergic mothers. Pediatr. Allergy Immunol. 12, 59-64 (2001).

論文

CAS

Google Scholar

Szepfalusi, Z. et al. 環境アレルゲンによるヒト免疫系の経胎盤的プライミングは、妊娠の早期から起こりうる。J. Allergy Clin. Immunol. 106, 530-536 (2000).

論文

CAS

Google Scholar

Vuillermin, P. J. et al. 妊娠中の母体のプレボテラ菌保有は、子孫の食物アレルギーに対する保護と関連する。Nat. Commun. 11, 1452 (2020).

論文

ADS

キャス

Google Scholar

Ganal-Vonarburg, S. C., Hornef, M. W. & Macpherson, A. J. Microbial-host molecular exchange and its functional consequences in early mammalian life.(哺乳類の初期生活における微生物-宿主間の分子交換とその機能的帰結)。Science 368, 604-607 (2020).

論文

ADS

CAS

Google Scholar

Lockhart, P. B. et al. 歯磨きと抜歯に関連する菌血症。Circulation 117, 3118-3125 (2008).

論文

CAS

Google Scholar

Fisher, R. A., Gollan, B. & Helaine, S. Persistent bacterial infections and persister cells(フィッシャー、R.A.、ゴラン、B.、ヘレイン、S. 持続性細菌感染とパーシスター細胞)。Nat. Rev. Microbiol. 15, 453-464 (2017).

論文

キャス

Google Scholar

De Boeck, I. et al. Lactobacilli Have a Niche in the Human Nose. Cell Rep. 31, 107674 (2020).

論文

Google Scholar

Lebeer, S., Vanderleyden, J. & De Keersmaecker, S. C. プロバイオティクス細菌表面分子の宿主相互作用:常在菌および病原体との比較. Nat. Rev. Microbiol. 8, 171-184 (2010).

論文

CAS

Google Scholar

Collins, J. et al. Lactobacillus salivarius septicaemia isolateのフィブリノーゲン結合および血小板凝集活性は、新規フィブリノーゲン結合タンパク質によって媒介されている。Mol. Microbiol. 85, 862-877 (2012).

論文

CAS

Google Scholar

Kankainen, M. et al. Lactobacillus rhamnosus GGの比較ゲノム解析により、ヒト粘液結合タンパク質を含む毛細血管が明らかになりました。Proc. Natl Acad. Sci. USA 106, 17193-17198 (2009).

論文

ADS

CAS

Google Scholar

Rampersaud, R. et al. Inerolysin, a cholesterol-dependent cytolysin produced by Lactobacillus iners. J. Bacteriol. 193, 1034-1041 (2011).

論文

CAS

Google Scholar

Wuyts, S. et al. Lactobacillus caseiグループの大規模系統樹は、分類学的不整合を強調し、新しいクレード関連機能を明らかにした。 mSystems 2, e00061-17 (2017).

論文

Google Scholar

Weinberg, E. D. The Lactobacillus anomaly: Total Iron abstinence(ラクトバチルス・アノマリー:鉄の完全摂取). Perspect. Biol. Med. 40, 578-583 (1997).

論文

CAS

Google Scholar

ハザーズ、E.ポー。B. et al. EFSAに通知された食品または飼料に意図的に添加されたQPS推奨生物学的製剤のリストの更新7:2017年9月までEFSAに通知された分類単位の適合性. EFSA J. 16, e05131 (2018).

Google Scholar

Cannon, J. P., Lee, T. A., Bolanos, J. T. & Danziger, L. H. Pathogenic relevance of Lactobacillus: a retrospective review of over 200 cases.(乳酸菌の病原性関連性:200例以上のレトロスペクティブレビュー)。Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 24, 31-40 (2005).

論文

CAS

Google Scholar

Richardson, E. J. et al. Gene exchange drives the ecological success of a multi-host bacterial pathogen. Nat. Ecol. Evol. 2, 1468-1478 (2018)に掲載されています。

論文

Google Scholar

Gordon, R. J. & Lowy, F. D. Pathogenesis of methicillin-resistant Staphylococcus aureus infection(メチシリン耐性黄色ブドウ球菌感染症の病態). Clin. Infect. Dis. 46 (Suppl. 5), S350-359 (2008).

論文

CAS

Google Scholar

Otto, M. Staphylococcus aureus toxins. Curr. Opin. Microbiol. 17, 32-37 (2014).

論文

CAS

Google Scholar

Powers, M. E. & Bubeck Wardenburg, J. Igniting the fire: 敗血症の病因における黄色ブドウ球菌の病原性因子。PLoS Pathog. 10, e1003871 (2014).

論文

Google Scholar

Healy, C. M., Baker, C. J., Palazzi, D. L., Campbell, J. R. & Edwards, M. S. Distinguishing true coagulase-negative Staphylococcus infections from contaminants in the neonatal intensive care unit.新生児集中治療室におけるコアグラーゼ陰性ブドウ球菌感染症の鑑別。J. Perinatol. 33, 52-58 (2013).

論文

CAS

Google Scholar

Michels, R., Last, K., Becker, S. L. & Papan, C. Update on coagulase-negative staphylococci-What the clinician should know(コアグラーゼ陰性ブドウ球菌の最新情報-臨床医が知っておくべきこと)。Microorganisms 9, 830 (2021).

論文

CAS

Google Scholar

コアグラーゼ陰性ブドウ球菌による新生児敗血症.Clin. Dev. Immunol. 2013, 586076 (2013).

論文

Google Scholar

Zhen, X., Lundborg, C. S., Sun, X., Hu, X. & Dong, H. ESKAPE生物における抗生物質耐性の経済的負担:システマティック・レビュー。Antimicrob. Resist. Infect. Control 8, 137 (2019).

論文

Google Scholar

Kamal, S. M., Simpson, D. J., Wang, Z., Ganzle, M. & Romling, U. Horizontal transmission of stress resistance genes shape the ecology of beta- and gamma-proteobacteria. Front. Microbiol. 12, 696522 (2021).

論文

Google Scholar

Kramer, A., Schwebke, I. & Kampf, G. How long do nosocomial pathogens persist on inanimate surfaces? システマティックレビュー。BMC Infect. Dis. 6, 130 (2006).

論文

Google Scholar

病院用繊維およびプラスチック上の腸球菌およびブドウ球菌の生存率。J. Clin. Microbiol. 38, 724-726 (2000).

論文

CAS

Google Scholar

Bizzarro, M. J. et al. Neonatal sepsis 2004-2013: the rise and fall of coagulase-negative staphylococci. J. Pediatr. 166, 1193-1199 (2015).

論文

Google Scholar

Dong, Y., Speer, C. P. & Glaser, K. Beyond sepsis: Staphylococcus epidermidis is an underestimated but significant contributor to neonatal morbidity.(敗血症を越えて:表皮ブドウ球菌は過小評価されているが、新生児の罹患に大きく寄与している)。Virulence 9, 621-633 (2018).

論文

Google Scholar

Glaser, M. A., Hughes, L. M., Jnah, A. & Newberry, D. Neonatal sepsis: a review of pathophysiology and current management strategies.新生児敗血症:病態生理と現在の管理戦略に関するレビュー。新生児ケア 21, 49-60 (2021).

論文

Google Scholar

Nan, C. et al. 母体B群レンサ球菌関連死産:システマティックレビュー. BJOG 122, 1437-1445 (2015).

論文

キャス

グーグルスクーラー

Vazquez-Boland, J. A., Krypotou, E. & Scortti, M. Listeria placental infection. mBio 8, e00949-17 (2017).の項参照。

論文

Google Scholar

DiGiulio, D. B. et al. 培養法および配列に基づく方法で評価した子癇前症の羊膜腔への微生物侵入。J. Perinat. Med. 38, 503-513 (2010).

論文

CAS

Google Scholar

DiGiulio, D. B. et al. 早産時の羊水における微生物の有病率、多様性および存在感:分子および培養に基づく調査。PLoS One 3, e3056 (2008). 早産の女性166人の羊水をPCRと培養で調べたところ、細菌検出と新生児の罹患率および死亡率がほぼ完全に正の相関を示したというシークエンス研究。

論文

ADS

Google Scholar

DiGiulio, D. B. et al. 羊水中の微生物の有病率および多様性、胎児の炎症反応、および早産前膜破裂の女性における妊娠転帰。Am. J. Reprod. Immunol. 64, 38-57 (2010).

Google Scholar

DiGiulio, D. B. et al. 妊娠期間中の小児胎児の妊娠における羊膜腔の微生物侵襲。J. Perinat. Med. 38, 495-502 (2010).

論文

Google Scholar

Enders, G., Daiminger, A., Bader, U., Exler, S. & Enders, M. 子宮内感染と妊娠年齢に関連するサイトメガロウイルス一次感染妊娠248例の臨床転帰。J. Clin. Virol. 52, 244-246 (2011).

論文

Google Scholar

Luckey, T. D. Germfree Life and Gnotobiology (Academic Press, 1963).

Rasmussen, S. A., Jamieson, D. J., Honein, M. A. & Petersen, L. R. Zika virus and birth defects-reviewing the evidence for causality(ジカウイルスと出生異常、因果関係の証拠を見直す)。N. Engl. J. Med. 374, 1981-1987 (2016).

論文紹介

キャス

Google Scholar

Falk, P. G., Hooper, L. V., Midtvedt, T. & Gordon, J. I. Creating and maintaining the gastrointestinal ecosystem: what we know and need to know from gnotobiology.消化管生態系の構築と維持:腸内生物学から知るべきこと。Microbiol. Mol. Biol. Rev. 62, 1157-1170 (1998).

論文

CAS

Google Scholar

ゴードン・H・A&ペスティ・L. 宿主微生物関係研究の道具としてのグノトビオティック動物(Gnotobiotic Animal as a tool in the study of host microbial relationships). Bacteriol. Rev. 35, 390-429 (1971).

論文

CAS

Google Scholar

Hooper, L. V. et al. 腸内常在菌の宿主-微生物関係の分子生物学的解析. Science 291, 881-884 (2001).

論文

ADS

CAS

Google Scholar

Wostman, B. S. Germfree and Gnotobiotic Animal Models. Background and Applications (CRC Press, 1996).

Arvidsson, C., Hallen, A. & Backhed, F. Generating and analyzing germ-free mice(無菌マウスの作製と解析)。Curr. Protoc. Mouse Biol. 2, 307-316 (2012).

Google Scholar

カーター、P.B.、ノリン、E.&スウェネス、A.G. ノトバイオティクスとマイクロバイオーム。In The Laboratory Rat 3rd edn (eds Suckow, M. A. et al.) Ch.21, 827-848 (2020).

Qv, L. et al. 無菌ラットモデルの確立と維持のための方法. Front. Microbiol. 11, 1148 (2020).

論文

Google Scholar

Schoeb, T. R. & Eaton, K. A. Gnotobiotics (Academic Press, 2017).

Jervis-Bardy, J. et al. Illumina MiSeqデータのポストシーケンス処理による細菌量の少ないヒトサンプルからの正確な微生物叢プロファイルの導出. マイクロバイオーム3, 19 (2015).

論文

Googleスカラー

Saffarian, A. et al. Crypt- and mucosa-associated core microbiotas in humans and their alteration in colon cancer patients. mBio 10, e01315-19 (2019).。

論文

Google Scholar

Jorissen, J. et al. Case-control microbiome study of chronic otitis with effusion in children points at Streptococcus salivarius as a pathobiont-inhibiting species. mSystems 6, e00056-21 (2021).小児慢性中耳炎の症例対照マイクロバイオーム研究。

論文

Google Scholar

Salzberg, S. 胎盤には細菌マイクロバイオームが存在するのか?フォーブス(2020年6月1日); https://www.forbes.com/sites/stevensalzberg/2020/06/01/does-the-placenta-have-a-bacterial-microbiome/?sh=7ae092ea250b.

Jost, T., Lacroix, C., Braegger, C. & Chassard, C. Assessment of bacterial diversity in breast milk using culture-dependent and culture-independent approaches.母乳の細菌多様性評価。Br. J. Nutr. 110, 1253-1262 (2013).

論文

CAS

Google Scholar

Treven, P. et al. 16S rRNA遺伝子次世代シーケンス(NGS)および培養/MALDI-TOF質量分析同定によるヒト乳汁微生物叢の評価. Front. Microbiol. 10, 2612 (2019).

論文

Google Scholar

Bihl, S. et al. When to suspect contamination rather than colonization-lessons from a putative fetal sheep microbiome.コロニー形成ではなく、汚染を疑うべきとき。Gut Microbes 14, 2005751 (2022).

論文

Google Scholar

ケネディ、K.M.ら、胎児微生物への曝露を過剰評価する。Cell 184, 5839-5841 (2021)。

論文

CAS

Google Scholar

Eisenhofer, R.ら、低微生物バイオマスのマイクロバイオーム研究における汚染:問題と提言(Contamination in low microbial biomass microbiome studies: issues and recommendations. Trends Microbiol. 27, 105-117 (2019).

論文

キャス

グーグルスカラー

参考文献のダウンロード

謝辞
T.B.はドイツ研究財団(BR2925 10-1 & PL241 16-1)から資金提供を受けています。F.D.B.はAI045008, AI120489, R33HL137063, CA219871, AI139240, PennCHOP Microbiome Programから資金援助を受けている。J.D.は、欧州連合のHorizon 2020研究・革新プログラムの下、欧州研究会議(ERC)からの資金提供を認める(助成金契約ERC-2017-AdG番号788191-Homo.symbiosus)。W.M.d.V.は、オランダ科学研究機構のグラビテーション助成金024.002.002の支援を受けています。W.M.d.V.とA.S.はフィンランドアカデミー(助成金1308255と1325103)の支援を受けている。A.M.E.は、米国国立衛生研究所(National Institutes of Health, Department of Health and Human Services)の国立アレルギー感染症研究所(NIAID)から、Broad Instituteへの助成番号U19AI110818による連邦資金の一部で資金提供を受けています。M.A.E.は、R01HD102318、R01HD098867およびR01NR014784の助成金を受けている。S.C.G.-V.はStiftung Molekulare Biomedizinから提供されたPeter Hans Hofschneider Professorshipによって資金提供を受けている。M.G.G.とD.M.S.はカナダ研究奨学金プログラムによる資金援助を受けている。L.J.H.はWellcome Trust Investigator Awards 100974/C/13/Z and 220876/Z/20/Z, Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) Institute Strategic Programme Gut Microbes and Health BB/R012490/1 and its constituent projects BBS/E/F/000PR10353 and BBS/E/F/000PR10356 から支援を受けています。M.W.H.は、欧州連合のHorizon 2020研究革新プログラムの下、ERCから資金援助を受けています(助成金契約番号:101019157)。S.L.は、欧州連合のホライゾン2020研究革新プログラムの下、ERCから資金援助を受けています(助成金契約番号852600 Lacto-Be)。A.J.M.は、ERCAd HHMM-Neonatesおよびスイス国立科学シネルジアから資金援助を受けています。O.K.は、欧州連合のHorizon 2020研究・革新プログラムの下、ERCの支援を受けています(助成金契約ERC-2020-COG番号:101001355)。P.W.O.、L.O.、J.W.の研究室での作業は、アイルランド科学財団(SFI)によるAPC Microbiome Irelandへのセンター賞(APC/SFI/12/RC/2273_P2)により支援されている。J.W.はSFI Professorship (19/RP/6853)による支援を受け、本調査の調整をしてくれたV. McMahonと励ましてくれたR. O'Callaghanに謝意を表する。J.R.は大学間特別研究基金(iBOF)フランダース(FLEXIGUT R-11423)、Rega Institute、VIBおよびKU Leuvenからの資金援助を受けた。N.S.はERC (ERC-STG project MetaPG-716575 and ERC-CoG microTOUCH-101045015) と欧州H2020プログラム (ONCOBIOME-825410 project, MASTER-818368 project and IHMCSA-964590) から資金提供を受けています。F.S.はアイルランド科学財団から一部支援を受けている。G.C.S.S.はMedical Research Council (UK; MR/K021133/1) およびNational Institute for Health Research (NIHR) Cambridge Biomedical Research Centre(女性の健康テーマ)から資金援助を受けていることを認めます。D.M.S.はCanadian Institute for Health ResearchとCanada Research Chairs Programから資金援助を受けている。A.W.W.はスコットランド政府のRural and Environment Science and Analytical Services(RESAS)からコア資金援助を受けている。M.Y.はAzrieli Faculty Fellowshipの支援を受けている。

著者情報
著者ノート
これらの著者は等しく貢献した。Katherine M. Kennedy, Marcus C. de Goffau

著者と所属
McMaster大学生化学・生物医学部(カナダ、オンタリオ州、ハミルトン市

Katherine M. Kennedy, Deborah M. Sloboda & Michael G. Surette(キャサリン・M・ケネディ、デボラ・スロボダ、マイケル・G・スレット

ファーンコム・ファミリー消化器健康研究所,マクマスター大学,カナダ,オンタリオ州,ハミルトン

Katherine M. Kennedy,Deborah M. SlobodaおよびMichael G. Surette

Tytgat肝臓・腸研究所、アムステルダム大学医療センター、オランダ・アムステルダム

Marcus C. de Goffau

オランダ・アムステルダム大学医学部血管医学教室

Marcus C. de Goffau & Trevor D. Lawley(マーカス・C・デ・ゴファウ&トレバー・ローリー

ウェルカム・サンガー研究所 (英国・ケンブリッジ

マーカス・C・ドゥ・ゴッファウ

アルバータ大学農業・食品・栄養科学学部(カナダ、アルバータ州エドモントン市

Maria Elisa Perez-Muñoz(マリア・エリサ・ペレス・ムニョス)& Michael G. Gänzle(マイケル・ゲンズル

国際マイクロバイオームセンター、カルガリー大学、カナダ、アルバータ州、カルガリー

Marie-Claire Arrieta

ワレンバーグ研究所、分子・臨床医学部、医学研究所、ヨーテボリ大学、スウェーデン、ヨーテボリ

Fredrik Bäckhed

スウェーデン・ヨーテボリ、ヴェストラ・イェータランド地方、カールグレンスカ大学病院、臨床生理学科

Fredrik Bäckhed

ノボ ノルディスク財団 基礎代謝研究センター、コペンハーゲン大学健康科学部、コペンハーゲン、デンマーク

Fredrik Bäckhed(フレドリック・ベッケド

構造・計算生物学ユニット、欧州分子生物学研究所 (ドイツ、ハイデルベルグ

ピアボーク

マックス・デルブリュック分子医学センター(ドイツ・ベルリン

ピア・ボーク

延世大学Yonsei Frontier Lab (YFL)(韓国・ソウル

ピア・ボーク

ヴュルツブルク大学バイオセンター バイオインフォマティクス学科 (ドイツ・ヴュルツブルク

ピア・ボーク

ベルリン・シャリテ大学産科・実験産科、ベルリン自由大学・ベルリンフンボルト大学法人会員 (ドイツ・ベルリン

トーステン・ブラウン

ペンシルバニア大学ペレルマン医学部微生物学教室(米国ペンシルバニア州フィラデルフィア

フレデリック・D・ブッシュマン

パリ・サクレー大学、INRAE、MetaGenoPolis、アグロパリテック、MICALIS、フランス、ジュイ=アン=ジョサス

ジョエル・ドール

ヘルシンキ大学医学部ヒトマイクロバイオーム研究プログラム(フィンランド、ヘルシンキ

Willem M. de Vos & Anne Salonen(ウィレム・M・デ・ヴォス&アン・サロネン

ワーヘニンゲン大学微生物学研究室 (オランダ、ワーヘニンゲン

ウィレム・M・デ・ヴォス

マサチューセッツ工科大学・ハーバード大学ブロード研究所 感染症・マイクロバイオームプログラム 米国マサチューセッツ州ボストン

アシュリー・M・アール

カリフォルニア大学デービス校進化・生態学部(米国カリフォルニア州デービス市

ジョナサン・A・アイゼン

カリフォルニア大学デービス校医学部微生物学・免疫学教室(米国カリフォルニア州デービス市

ジョナサン・A・アイゼン(Jonathan A. Eisen

UCデイビス・ゲノムセンター カリフォルニア大学 デイビス校(米国カリフォルニア州デイビス市

ジョナサン・A・アイゼン(Jonathan A. Eisen

母子保健研究センター、産科婦人科、ペンシルバニア大学ペレルマン医学部、ペンシルバニア州フィラデルフィア、米国

ミハエル・A・エロビッツ

ベルン大学病院視覚外科・医学部(スイス・ベルン

ステファニー・C・ガナル=ヴォナルブルク

ベルン大学医学部生物医学研究学科(DBMR)(スイス・ベルン

Stephanie C. Ganal-VonarburgおよびAndrew J. Macpherson

ハーバード大学T.H.Chan公衆衛生学部免疫学・感染症学科(米国マサチューセッツ州ボストン市

ウェンディ・S・ギャレット、カーティス・ハッテンハワー

ハーバード大学T.H.チャン公衆衛生学部マイクロバイオームセンター(米国マサチューセッツ州ボストン

Wendy S. Garrett(ウェンディ・S・ギャレット

ダナファーバー癌研究所・ハーバード大学医学部医学科・腫瘍学教室(米国マサチューセッツ州ボストン市

ウェンディ・S・ギャレット(Wendy S. Garrett

ハーバード大学・MITのブロード研究所(米国マサチューセッツ州ケンブリッジ

ウェンディ・S・ギャレット、カーティス・ハッテンハワー

クアドラム研究所バイオサイエンス、ノリッジ・リサーチ・パーク、英国、ノリッジ

リンゼイ・J・ホール

イースト・アングリア大学ノリッチ医学部(英国・ノリッチ

Lindsay J. Hall(リンゼイ J. ホール

ミュンヘン工科大学生命科学部ZIEL-Institute for Food and Health(腸内マイクロバイオーム研究室)、ドイツ、フライジング

リンゼイ J. ホール

ドイツ、アーヘン、RWTH大学病院、医療微生物学研究所

Mathias W. Hornef

ハーバード大学T.H.Chan公衆衛生学部生物統計学科(米国マサチューセッツ州ボストン市

カーティス・ハッテンハワー

米国コネチカット州ニューヘブン,イェール大学医学部,小児科・産科・婦人科・生殖科学科

ライザ・コンニコワ

アントワープ大学バイオサイエンス工学部(ベルギー、アントワープ

サラ・ルベール

APCマイクロバイオーム アイルランド、コーク大学、アイルランド

Ruth C. Massey, Liam O'Mahony, Paul W. O'Toole, Fergus Shanahan & Jens Walter(ルース・C・マッセイ、リアム・オマホニー、ポール・W・オトゥール、ファーガス・シャナハン、イェンス・ウォルター

アイルランド、コーク、コーク・カレッジ、微生物学部

Ruth C. Massey、Liam O'Mahony、Paul W. O'Toole、Jens Walter

感染研究の計算生物学、ヘルムホルツ感染研究センター(ドイツ、ブラウンシュヴァイク

アリス・キャロリン・マクハーディー

ドイツ感染症研究センター(DZIF)、ハノーバーブラウンシュヴァイクサイト、ドイツ・ブラウンシュヴァイク

アリス・キャロリン・マクハーディー(Alice Carolyn McHardy

ブラウンシュヴァイク統合システム生物学センター(BRICS)、ブラウンシュヴァイク工科大学、ドイツ・ブラウンシュヴァイク

アリス・キャロリン・マクハーディー

バルイラン大学アズリエリ医学部 (イスラエル、サフェド

オムリ・コレン

マックス・プランク発生生物学研究所マイクロバイオーム科学部門(ドイツ・テュービンゲン

ルース・E・レイ

アイルランド、コーク、コーク大学医学部

リアム・オマホニー、ファーガス・シャナハン、イェンス・ウォルター

シカゴ大学デュコソイ・ファミリー研究所(米国イリノイ州シカゴ

エリック・G・パマー

ケンブリッジ大学獣医学部(英国・ケンブリッジ

ジュリアン・パークヒル

VIB微生物学センター(ベルギー、ルーヴェン

イェルーン・レーズ

ベルギー、ルーバン、KUルーバン、レガ研究所、微生物学・免疫学・移植学科

Jeroen Raes(イェルーン・レーズ

ウィーン大学微生物学・環境システム科学センター(オーストリア・ウィーン

トーマス・ラッテイ

ワイツマン科学研究所(イスラエル、レホボト

Eran Segal

トレント大学CIBIO学部(イタリア・トレント

ニコラ・セガータ

欧州腫瘍学研究所(IEO)、IRCCS、イタリア・ミラノ

Nicola Segata

マクマスター大学小児科、カナダ、オンタリオ州、ハミルトン

Deborah M. Sloboda

マクマスター大学産科婦人科学科(カナダ・オンタリオ州ハミルトン市

Deborah M. Sloboda(デボラ M. スロボダ

英国ケンブリッジ大学・産科婦人科学教室

ゴードン・C・S・スミス

NIHRケンブリッジ生物医学研究センター(英国・ケンブリッジ

ゴードン・C・S・スミス(Gordon C. S. Smith

AP-HP, Saint Antoine Hospital, Centre de Recherche Saint-Antoine, CRSA, INSERM and Sorbonne Université, Paris, France 消化器科

ハリー・ソコル

パリ微生物医学センター(PaCeMM)、Fédération Hospitalo-Universitaire, Paris, France

ハリー・ソコル

ミカリス研究所、INRAE、アグロパリテック、パリサクレー大学、フランス、ジュイ・アン・ジョザス

ハリー・ソコル

キングス・カレッジ・ロンドン、双子研究部門(英国・ロンドン

Tim D. Spector

マクマスター大学医学部、カナダ、オンタリオ州、ハミルトン

マイケル・G・スレット

オタゴ大学微生物学・免疫学教室(ニュージーランド,ダニーデン

ジェラルド・W・タノック

アバディーン大学ロウェット研究所腸健康グループ(英国アバディーン市

アラン・W・ウォーカー

エルサレム・ヘブライ大学コンピューターサイエンス・エンジニアリング学部(イスラエル、エルサレム

モラン・ヤスール

ヘブライ大学医学部微生物学・分子遺伝学教室(イスラエル、エルサレム

モラン・ヤスール

寄稿
N.S.とJ.W.がプロジェクトを企画した。K.M.K.とM.C.d.G.は解析と図の作成を行った。K.M.K.、M.C.d.G.、M.E.P.-M、F.D.B、M.A.E、S.C.G-V、M.G.G、M.W.H、 A.J.M 、R.C.M 、E.G.P 、 J.P 、F.S 、D.M.S 、 G.C.S.、G.W.T 、A.W.W と J.W は原稿を書いている。すべての著者がフィードバックを提供し、議論に参加し、原稿の最終版に貢献した。

共著者
Jens Walterに連絡する。

倫理的宣言
利益相反
著者は、競合する利益を宣言していない。

査読
査読情報
Natureは、この論文の査読に貢献したDavid Relman、Julia Segre、Sing Sing Wayに感謝します。

その他の情報
出版社からのコメント Springer Natureは、出版された地図や所属機関に関する管轄権の主張に関して中立的な立場を維持しています。

権利と許可
Springer Natureまたはそのライセンサー(例:学会またはその他のパートナー)は、著者またはその他の権利者との出版契約に基づき、本論文の独占的権利を有します。本論文の受理済み原稿の著者によるセルフ・アーカイブは、当該出版契約の条項および適用法のみに従います。

転載と許可

この記事について
クロスマークで通貨と真偽を確認する
この記事の引用
Kennedy, K.M., de Goffau, M.C., Perez-Muñoz, M.E. et al. 胎児マイクロバイオームへの疑問は、低バイオマス微生物研究の落とし穴を示している。Nature 613, 639-649 (2023)。https://doi.org/10.1038/s41586-022-05546-8。

引用文献のダウンロード

受付終了
2021年6月11日

Accepted
2022年11月09日

公開日
2023年1月25日発行

発行日
2023年1月26日

DOI
https://doi.org/10.1038/s41586-022-05546-8

この記事が気に入ったらサポートをしてみませんか?