一からコーディングする際はどのように作るのでしょうか？

今回は授業と言うことでファイルが用意してあり、すでに問題以外の部分はタグなどが入った状態ですが、例えば仕事などで一からコーディングする際は、まっさらな状態で作っていく感じになるのでしょうか。

仰る通りです。
仕事などで１からコーディングする際にはまっさらな状態から作ることになります。
改修案件などの場合は、既にある他の人が書いたコードを基に修正していくことになります。
はじめは１からコーディングする方が大変に思うかもしれませんが
意外と他人が書いたコードを修正するより1からコーディングする方が楽なことが多いです。
一通りの基礎勉強がおわりましたら
ご自分のサイトを１から作ってみるのも勉強になります。