(解決?済)macOS VenturaのPythonでSegmentation fault: 11が出た

環境
MacBook Pro 14-inch 2021
macOS Ventura 13.5.2
Apple M1 Max
Memory 64 GB

状況
タンパク質非構造領域予測プログラムmetapredictをpipでインストール・実行してSegmentation fault: 11が出た。

参考

$ pip install metapredict
$ metapredict-predict-disorder test.fasta
Segmentation fault: 11
$

解決
何の情報もなくて困った。pipでインストールされていたパッケージを全部アンインストールしてmetapredictを再インストールした。

$ pip freeze > requirements.txt
$ pip uninstall -r requirements.txt

# 中略

$ pip3 install cython # 入れろと言われた。
$ pip3 install numpy # 入れろと言われた
$ pip3 install metapredict
$ metapredict-predict-disorder test.fasta
100%|█████████████████████████████████████████████| 3/3 [00:00<00:00, 19.11it/s]
$ 

なおpipもアンインストールで消えた。pip3だけ残っているのでpip3 install pipでインストールしたがTerminal再起動必要。

よかったですね。よかったのか?


この記事が気に入ったらサポートをしてみませんか?