クリスタがVer.1.12.7にアップデートされたことにより、3Dプリミティブの機能も追加されましたので記事も追記しました。
ちなみに今回のアップデートで3D素材がキャンバス全体に貼り付けられる謎仕様がなくなりました。
https://dentakumanga.com/clipstudiopaint-3dprimitive/