【一次情報あり】新型コロナウイルスのRNAは人間のＤＮＡに取り込まれる可能性がある

「SARS-CoV-2 RNAは逆転写され、ヒトゲノムに統合される」とする以下の論文が投稿されています。

Zhang, Liguo, Alexsia Richards, Andrew Khalil, Emile Wogram, Haiting Ma, Richard A. Young, and Rudolf Jaenisch. “SARS-CoV-2 RNA reverse-transcribed and integrated into the human genome.” bioRxiv (2020).

SARS-CoV-2 RNA reverse-transcribed and integrated into the human genome

この論文は2020年末に投稿されて、2021年5月にようやく査読の審査をクリアし、正式な論文として採録されました。以下の論文が正式な一次情報になります。

Reverse-transcribed SARS-CoV-2 RNA can integrate into the genome of cultured human cells and can be expressed in patient-derived tissues

https://www.pnas.org/content/pnas/118/21/e2105968118.full.pdf

査読前の論文に対して、Dr.Dougのブログでは以下のように書かれています。自動翻訳文を掲載します。

Breaking Study Sheds More Light on Whether an RNA Vaccine Can Permanently Alter DNA

私は、この研究の重要性は、彼らの仕事に穴を突こうとする専門家からの報告で迅速に最小限に抑えられるという疑わしい気持ちを持っています。このペーパーは、まだ査読されていないプレプリントであることを追加することが重要です。しかし、私はすべてのデータ、方法、結果を調べましたが、私は論文にほとんど間違いがないか、そして閉じる必要があるいくつかのギャップを見ていますが、少なくともコロナウイルスからのRNAは既存の細胞経路を使用してDNAに永久に統合できますか?その観点から、彼らの論文は堅実です。また、これらはMITとハーバード大学の尊敬される科学者であることに注意してください。
彼らの論文から引用:
「この仮説を支持して、我々は、患者のSARS-CoV-2感染培養細胞および原細胞の公開されたデータセットにおいて、ウイルスが細胞配列に融合して融合したキメラな転写を発見し、ゲノムに組み込まれたウイルス配列の転写と一致した。ウイルスレトロインテグレーションの可能性を実験的に裏付けるために、SARS-CoV-2 RNAは、LINE-1要素またはHIV-1 RTによる逆転写酵素(RT)によってヒト細胞内で逆転転写され、これらのDNA配列を細胞ゲノムに統合し、その後転写することができるという証拠を記述する。ヒト内因性LINE-1発現は、SARS-CoV-2感染時または培養細胞におけるサイトカイン曝露によって誘導され、患者におけるSARS-CoV-2レトロインテグレーションの分子機構を示唆した。SARS-CoV-2感染のこの新しい特徴は、患者が回復後もウイルスRNAを産生し続けることができる理由を説明し、RNAウイルス複製の新しい側面を示唆しているかもしれない。
なぜこれらの研究者は、ウイルスRNAが私たちのゲノムDNAにハードワイヤードされる可能性があるかどうかをわざわざ調査したのですか?彼らの動機はmRNAワクチンとは何の関係もなかったことが判明した。研究者たちは、感染がなくなった後、PCRによってCOVID-19の陽性反応を示している人が立派な数いるという事実に戸惑いました。また、これらの人々は再感染していないことを示しました。著者らは、ウイルスが人の体内に存在しないと思われる場合に、PCRテストがウイルスRNAのセグメントを検出する方法に答えようとした。彼らは、ウイルスRNAのセグメントが何らかの形でDNAにコピーされ、体細胞のDNAに永久に統合されていると仮定した。これにより、これらの細胞は、アクティブな感染が存在しないにもかかわらず、PCRテストで検出されるウイルスRNAの断片を連続的に解約することができます。実験を通じて、ゲノムDNAに組み込まれた全長ウイルスRNAは見つからなかった。むしろ、ウイルスDNAのより小さなセグメントを発見し、主にウイルスのヌクレオキャプシド(N)タンパク質を表すが、他のウイルスセグメントは低頻度でヒトDNAに統合されたことがわかった。
この論文では、次のことが実証されています。
1) SARS-CoV-2ウイルスRNAのセグメントは、ヒトゲノムDNAに統合され得る。
2)この新たに獲得したウイルス配列は静かではなく、ゲノムDNAのこれらの遺伝子組み換え領域が転写活性であることを意味する(DNAはRNAに戻される)。
3) 細胞培養におけるヒトゲノムDNAにレトロに統合されたSARS-CoV-2ウイルスRNAのセグメント。COVID-19患者のゲノムDNAへのこのレトロな統合はまた、COVID-19患者由来の細胞におけるキメラRNA転写物の検出から間接的に暗示される。彼らのRNAEqデータは、ゲノム変化がCOVID-19患者で起こっていることを示唆しているが、この点を決定的に証明するために、PCR、DNAシーケンシング、またはサザンブロットは、この点を決定的に証明するためにCOVID-19患者の精製ゲノムDNAに対して行われるべきである。これは、研究で閉じる必要があるギャップです。しかし、ヒト細胞株のインビトロデータは気密性が高い。
4)このウイルスによるRNAのDNAへのレトロなDNA組み込みは、RNAをDNAに変換する活性な逆転写酵素(RT)を産生する内因性LINE-1レトロトランスポゾンによって誘導することができる。(すべてのヒトは、ゲノムに存在するLINE-1レトロトランスポゾンの複数のコピーを持っています。ウイルスRNAをDNAにレトロに集積する頻度は、細胞内のLINE-1発現レベルと正の相関性を持つ。
5)これらのLINE-1レトロトランスポゾンは、SARS-CoV-2、または細胞へのサイトカイン暴露によるウイルス感染によって活性化することができ、これはレトロインテグレーションの確率を増加させる。

査読が通って正式に発表された際のタイのニュースで自動翻訳文を掲載します。

BREAKING NEWS: New Research By MIT And NCI Provides Further Evidence Of Controversial Claims That SARS-Cov-2 Genes Can Integrate With Human DNA! - Thailand Medical News

ニュース速報:マサチューセッツ工科大学ケンブリッジ校、国立がん研究所メリーランド州、ホワイトヘッド生物医学研究所ケンブリッジの研究者は、SARS-CoV-2遺伝子がヒト宿主DNAに統合することができるという論争の的となっている主張を裏付けるさらなる証拠を新しい研究で発見しました。
研究結果は、ピアレビュージャーナルに掲載されました: PNAS (米国科学アカデミー紀要).
https://www.pnas.org/content/118/21/e2105968118
タイのメディカルニュースがハーバード大学とMITの研究者によって2020年12月に行われた最初の研究を取材したとき、世界中の多くの無知な研究者は、この研究は信用できない、さらには偽物であると却下しました。https://www.thailandmedical.news/news/covid-19-news-harvard-and-mit-study-alarmingly-shows-that-sars-cov-2-rna-integrates-into-human-genome-with-varying-implications
著名な科学者からなる研究チームは、パンデミックコロナウイルスの遺伝的ビットが私たちの染色体に統合し、感染が終わった後に長く固執することができるという論争の仮説を倍増しました。
興味深いことに、ウイルス遺伝子挿入は、人々がCOVID-19から回復することができるが、数ヶ月後に再びSARS-CoV-2の陽性をテストすることができるというまれな発見を説明
することができる。
この研究を主導したマサチューセッツ工科大学の一流幹細胞生物学者のudolf Jaenisch博士と遺伝子調節スペシャリストのリチャード・ヤング博士は、2020年12月に彼らのチームが最初にこのアイデアをプレプリントで発表したとき、ツイッターの嵐を引き起
こしました。
彼らの研究仲間と一緒に彼らの両方は、ウイルス統合はCOVID-19から回復した人々が感染性のままであることを意味しないことを強調
しました。
しかし、無知な批評家は、メッセンジャーRNA(mRNA)に基づくCOVID-19ワクチンが何らかの形でヒトDNAを変えるかもしれないという根拠のない恐怖を盗んで彼らを告発
した。
これらのいわゆる「専門家」兼批評家はまた、科学的批判のブレースを提示し、そのうちのいくつかはチームが新しい研究結果で取り組
んでいます。
ハエニッシュ博士はタイメディカルニュースに対し、「コロナウイルス配列がヒトゲノムに統合できるという明確な証拠が今ある」と語
った。
SARS-CoV-2にはRNAで構成される遺伝子があり、ジェイニッシュ、ヤング、そして共著者は、まれにヒト細胞の酵素がウイルス配列をDNAにコピーして染色体に滑り込む可能性があると主張
している。
研究グループは、張博士、Jaenisch博士らは、小さなウイルス配列に隣接するDNAを調べ、彼らがそこに着いたメカニズムの手がかりを得
た。これらの周囲の配列では、研究者はレトロトランスポゾンと呼ばれる遺伝的特徴の特徴を発見しました。
「ジャンプ遺伝子」とも呼ばれるトランスポゾンは、ゲノムのある領域から別の領域に移動できるDNAのセクション
です。彼らはしばしば高ストレスの状態で、または癌または老化の間に「ジャンプ」するために活性化され、そして、パウです
遺伝的変化のrfulエージェント。
ヒトゲノムの一般的なトランスポゾンの1つは、DNA切断機械と逆転写酵素(SARS-CoV-2のRNAのような)からDNA分子を作り出す酵素の強豪組合せで構成されるLINE1レトロトランスポゾンと呼
ばれています。
細胞酵素である逆転写酵素は、LINE-1要素、ヒトゲノムの17%を散らかし、レトロウイルスによる古代感染症の人工物を表す配列によってコード化
される。研究者たちは、元のプレプリントでは、余分なLINE-1要素でスパイクされたヒト細胞がコロナウイルスに感染したとき、細胞の染色体に入ったSARS-CoV-2の配列のDNAバージョンが付いているという試験管の証拠を提示した。
LINE-1要素やその他の「レトロトランスポゾン」を専門とする多くのゲノムおよび細胞生物学者は、データが薄すぎてこの主張を支持していると考
えていた。
コーネル大学の元評論家、セドリック・フェショッテ博士は、ヒトゲノムの内因性レトロウイルスチャンクを研究し、「もし私がこのデータを持っていたら、その時点で出版物に提出しなかったでしょう」と後悔
しています。
彼のような多くは、最初の研究が出たときに、彼らはジェイニッシュ博士とヤング博士の口径の科学者から来るより高品質の仕事を期待していると言
っていました。
bioRxivに掲載された2つのその後の研究では、批評家は、ヒトおよびウイルスDNA痕跡の想定されるキメラは、グループが染色体でそれらをスキャンするために使用されたまさに技術によって日常的に作成されているという証拠を提示
した。
ある報告が結論付けたように、ヒトウイルス配列は「本物の逆転写、統合および発現の結果よりも、方法論的産物である可能性が高い
」。
このニュース研究のジェイニッシュ博士、ヤング博士らは、彼らが使用した技術が誤ってヒトウイルスキメラを作り出したことを認
めている。「私はそれが有効なポイントだと思います」と、イェニッシュ博士は言います。
彼は、彼らが最初にジャーナルに論文を提出したとき、彼らはそれがレビュープロセス中に追加することを望んでいたより強力なデータが必要であることを知っていたと付け加
えました。しかし、多くのジャーナルと同様に、著者はすべてのCOVID-19結果をプリプリントサーバーに直ちに投稿する必要があります。「私はおそらくあなたをねじ込むと言うべきでした、私はbioRxivにそれを置くことはありません。それは誤った判断でした」とイェニッシュ博士は言います。
この新しい論文の研究チームは、アーティファクトだけではウイルス-ヒトキメラDNAの検出されたレベルを説明できないという証拠を提供
する。
研究者はまた、LINE-1要素の一部が統合されたウイルス遺伝的配列に隣接し、その仮説をさらに支持することを示
している。そして、彼らは元の懐疑論者の一人、国立がん研究所のスティーブン・ヒューズ博士と協力し、人間に対する統合されたウイルス配列の向きに基づいて、統合が本物か騒音かを明らかにする実験を提案しました。
この研究結果は元の仮説を裏付けている、と新論文の共同執筆者ヒューズは言
う。「その分析は重要であることが判明しました」と彼は言います。
「細胞培養における統合データは、プレプリントで提示されたものよりもはるかに説得力がありますが、まだ完全にきれいではありません」と、現在はイェニッシュ博士とヤング博士の仮説を「もっともらしい」と呼んでいるフェショッテ博士は言
います。(SARS-CoV-2は、遺伝子を統合することなく、何ヶ月も人に持続できると指摘しています。
しかし、本当の問題は、細胞培養データが人間の健康や診断に関連しているかどうか
です。「患者の統合の証拠がない場合、これらのデータから取り除くことができる最も多くのことは、L1が過剰発現している感染細胞株でSARS-CoV-2 RNAの遡及事象を検出することができるということです。
フェショッテ博士は、「これらの観察の臨床的または生物学的意義は、もしあるとしても、この時点で純粋な憶測の問題である」と付け加
えた。
Jaenisch博士とヤング博士のチームは、COVID-19患者の生活と解剖から組織におけるSARS-CoV-2統合のヒントを報告
しています。
重要なことに、研究チームは、細胞がタンパク質を作るためにその配列を読み取る間にのみ、統合されたウイルスDNAによってのみ産生されるRNAのタイプの高レベルを発見
しました。しかし、ヤングは「我々はまだその直接的な証拠を持っていない」と認めます。
フレッド・ハッチンソンがん研究センターのヒトゲノム中の古代ウイルスの専門家であるハーリット・マリク博士は、ウイルスをクリアすべき個人がその配列に対して陽性のポリメラーゼ連鎖反応検査を受ける理由を尋ねるのは「正当な質問」だと言
います。しかし、彼はまた、説明が統合されたウイルスであることを確信していないままです。
「通常の状況下では、ヒト細胞には逆転写機械はほとんどありません」とマリク博士は言
います。
興味深いことに、論争は12月以来、決定的により市民的に成長
しています。ヤング博士とイェニッシュ博士は、一部の研究者が新たに承認されたmRNAワクチンに関する虚偽の主張を広めるワクチン懐疑論者の手に渡ることを心配したため、彼らのキャリアのどの研究よりも彼らのプレプリントに対してより激しい批判を受けたと言います。
「削除すべきプレプリントがあったら、これ
です!関連する証拠の完全な欠如を考えると、それをプレプリントとして掲げることさえ無責任でした。これは現在、新しいワクチンに対する疑念を広めるために一部の人々によって使用されています」と、バージニア大学の微生物学者マリー・ルイーズ・ハマルスキョルド博士は、当時のbioRxivに関するコメントに投稿しました。
しかし、新しい証拠が発表されたとき、マリー博士は今静かに
していました。
この研究結果は、ファイザーとモダナの両方によるmRNAベースのCOVID-19ワクチンに大きな影響を与
える。この研究結果はまた、長期的な健康への影響や状態、すなわちLONG COVIDに関して大きな意味を持ち、また、タイのメディカルニュースは、mRNAワクチンとヒトゲノムへの影響に関して既に進行中の研究に関するより多くの更新を提供し、またLONG COVIDに関する研究を提供する。

以上の論文や多数の医学研究結果から、新型コロナ感染症から回復した患者がＰＣＲ陽性となる場合がある原因は、ウイルスのＲＮＡがヒトゲノム内に統合されることであることを突き止めました。

感染者全員にこのような人体の遺伝子組み換えが起こる訳ではないと考えられますが、感染によってウイルスのRNAが人体のDNAに取り込まれた場合は、長期間（場合によっては一生涯）に渡ってウイルスに免疫システムが攻撃される可能性や、他人に感染させる可能性が考えられます。一度感染した人が数ヶ月後に再感染している実態も本当に外部からの感染なのか、調査する必要があります。

つまり、新型コロナウイルスのRNAが人間のDNAに取り込まれるのはデマだとする言説は間違いであると言えます。

同様に、mRNAとRNAは役割が違うだけで、本質的な違いはありません。そのため、mRNAワクチンが人間の遺伝子に取り込まれるのはデマだとする話も同様に間違いであると言えます。

むしろ、以下の以前の投稿でご説明した通り、mRNAワクチンは細胞内で長期間留まることから、DNAに取り込まれる可能性も飛躍的に高まります。このことは、上記Dr.Dougのブログでも書かれています。これについては別記事で改めてまとめます。
https://note.com/covnote/n/nf54d0277b0fd

また、この論文はタイのニュースにある通り、査読が通るまでの間、新型コロナウイルスがDNAに取り込まれるという研究は偽物だデマだという不当な扱いを受けながらも証拠を示し続けて戦っていたことがうかがえます。これには一考の価値があると考えます。YoutubeやFacebookだけでなく、権威があるとされる学会においても、ワクチンの批判や武漢研究所流出説に繋がる研究が抑圧されてきた実態が垣間見えます。これについては別記事でまとめます。